細菌_研究 アーカイブ - TechnoSuruga Laboratory Co.,Ltd. 微生物試験・分析と理化学分析 Mon, 20 Oct 2025 03:03:00 +0000 ja hourly 1 https://wordpress.org/?v=6.8.3 https://tecsla.jp/tec/wp-content/uploads/2023/08/logo.png 細菌_研究 アーカイブ - TechnoSuruga Laboratory Co.,Ltd. 32 32 細菌DNA塩基配列解析・分子系統解析 (16S rDNA) https://tecsla.jp/services/microbiological/to-researcher/bacteria/dna-bacteria/ Tue, 15 Oct 2024 01:30:03 +0000 https://www.tecsrg.co.jp/?page_id=286064 投稿 細菌DNA塩基配列解析・分子系統解析 (16S rDNA) は TechnoSuruga Laboratory Co.,Ltd. に最初に表示されました。

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細菌DNA塩基配列解析・分子系統解析 (16S rDNA)

特長

  • 当社微生物同定システム「ENKI®」を使用し、分子系統解析まで実施

  • 基準株の塩基配列データで構成される「微生物同定データベース」で解析

  • 帰属種・近縁種のバイオセーフティレベル付きで報告

  • スクリーニングから新種提唱論文用データまで幅広く対応

概要

細菌の同定に一般に用いられている16S rDNAでは、上流側の約500 bpの部分塩基配列で近縁種の同定がほぼ可能ですが、全長配列(Full)を解析する方がより同定の精度が高くなり、帰属種・近縁種の同定に優れます。特に、細菌を新種提唱する場合には、サンガー法による16S rDNA全長の決定と分子系統解析が必須となります。また、微生物特許寄託の際、同属内にBSL3以上が含まれる場合には、DNA塩基配列解析による安全性の確認が必要となることがあります。
当社では近隣結合法 (NJ; Maximum Neighbor Joining) のように距離行列 (Distance matrix) による手法および、最尤法 (ML; Maximum Likelihood) を基本とし、最節約法 (MP; Maximum Parsimony) による分子系統解析にも対応可能です。

受入可能な検体

種類

必要量

備考

平板培養物

1 枚

当社で培養確認を行うか、指定コロニーから直接DNA を抽出するかのご選択が可能です。生育性や純粋性に疑義がある場合には、ご連絡します。

液体培養物

スラント ( 斜面培養物 )

アンプル ・ 凍結保存品 ( グリセロールストック)

1 本

当社での培養確認を必須とします。培養条件をご指示下さい。液体培養物から直接解析を実施する場合、承諾書にご署名をいただきます。

DNA 抽出物

濃度 ： 30 ng/µL 以上
量 ： 50 µL 以上

PCR 増幅を確認している場合には、電気泳動像のご提供をお願いします。承諾書にご署名をいただきます。

PCR 産物

濃度 ： 100 ng/µL 以上
量 ： 20 µL 以上

電気泳動像のご提供をお願いします。承諾書にご署名をいただきます。

塩基配列テキストファイル
(fasta ファイルなど)
シーケンス生データ
(ab1 ファイル)

―

オプションの簡易分子系統解析、分子系統解析のみのご依頼となります。

シーケンサーから出力された生データ (ab1 ファイル) から塩基配列を決定し、解析することも可能です。ab1 ファイルの場合はプライマー配列情報をご提供ください。

解析の流れ

  • 純度確認

  • DNA抽出

  • PCR増幅

  • シーケンス

  • 塩基配列決定

  • 相同性検索

  • 系統解析

納品内容

試験項目

報告内容

付属データ

16S rDNA-500 (ENKI BLAST)

16S rDNA-Full (ENKI BLAST)

・当社微生物同定データベース照合結果の上位30位

・ DNA塩基配列データ
・ シーケンス波形データ

16S rDNA-500
16S rDNA-Full

・国際塩基配列データベース照合結果の上位30位
・当社微生物同定データベース照合結果の上位30位
・系統樹
・同定結果 ＋帰属種・近縁種のバイオセーフティレベル

16S-rDNA 500 と Fullの違い

■主な解析目的
品質管理、衛生管理、スクリーニング

■長所
・最小限のプライマーによるシーケンスでコスト安
・属および近縁種の同定が可能

■短所
・解析する塩基配列が短いため、同定の精度がFull と比較してやや劣る
・近縁種が複数候補にあがり、一種に絞り切れない場合がある

■主な解析目的
研究開発、学術研究

■長所
・16S-500 よりも、解析する塩基配列が長いため、同定の精度が高い

■短所
・PCR プライマーと中間プライマーによるシーケンスが必要となり、コスト高い

報告書サンプル

SAMPLE／16S rDNA-500 (BLAST) 報告書v1.12のサムネイル

価格・納期

※年間契約割引 (年間100株以上) も用意しています。

試験項目

検体数

単位

単価 (通常)（税抜）

単価 (特急)※¹（税込）

目安納期

16S rDNA-500 (ENKI BLAST)

1～8

株

16,000 円

―

6 営業日

9～16

15,000 円

―

7 営業日

17～24

お問い合わせ下さい

25～

お問い合わせ下さい

16S rDNA-500

1～8

株

21,000 円

24,200 円

9 営業日

9～16

20,000 円

23,000 円

10 営業日

17～24

お問い合わせ下さい

25～

お問い合わせ下さい

試験項目

検体数

単位

単価(通常) （税抜）

単価 (特急)※¹（税込）

目安納期

16S rDNA-Full(ENKI BLAST)

1～8

株

37,000 円

―

6 営業日

9～16

32,000 円

―

7 営業日

17～24

お問い合わせ下さい

25～

お問い合わせ下さい

16S rDNA-Full

1～8

株

43,000 円

50,400 円

9 営業日

9～16

37,000 円

43,400 円

10 営業日

17～24

お問い合わせ下さい

25～

お問い合わせ下さい

※1　DNA特急は、5営業日で当社微生物同定データベースに対し相同性検索結果の上位5位をE-メールで報告します。また、一度にお受けできる検体数は8株までです。

  • 常用培地以外の培地や嫌気条件での培養などをご指定の場合、追加費用が必要となります。【ガイド】 追加費用のご案内をご参照下さい。
  • ご希望のお客様には、帰属種・近縁種の分離源情報を提供します(試験項目 ENKI BLAST は対象外)。
    オプション
    • 簡易分子系統解析や分子系統解析は、お手持ちのシーケンスデータ (ab1ファイル) や塩基配列テキストファイルから行うことも可能です。
    • 分子系統解析は、近隣結合法 (NJ法) の他、最節約法 (MP法) や最尤法 (ML法) も対応します。
    • 細菌、放線菌の16S rDNA-500および16S rDNA-FullのDNAメニューでは、オプションで考察(同定に至った経緯の説明文章) 付きに変更が可能です。

    試験項目

    報告内容

    単位

    単価（税抜）

    納期

    配列比較

    ご指定の微生物株の配列比較 ( アライメント) を行い、相違箇所を明確にします。

    2 株間比較

    ＋ 1,000 円

    ＋ 1 営業日

    3 株間比較

    ＋ 2,000 円

    簡易分子系統解析

    16S rDNA テキストデータから当社微生物同定システム「ENKI®」により分子系統解析し、帰属種・近縁種を推定します。

    株

    考察なし

    8,000 円

    5 営業日

    考察あり
    10,000 円

    6 営業日

    シーケンス生データ (ab1 ファイル) から塩基配列を決定します。

    株

    配列決定

    ＋ 5,000 円

    ＋ 1 営業日

    分子系統解析※³
    (16S rDNA)

    論文投稿などを前提とした分子系統樹を作成し、検体の帰属種・近縁種を推定します。
    既報の調査、新種データの確認、必要な塩基配列の選定および取得を行い、「BioEdit」および「MEGA」を用いて分子系統樹を描画し、系統的な位置を推定します。報告は分子系統樹データを「PowerPoint」ファイルで納品します。
    なお、ご指定のない場合、近隣結合法 (NJ 法) による系統樹作成となります。

    株

    シーケンス＋分子系統解析

    74,000 円～

    20 営業日～

    分子系統解析のみ

    37,000 円～

    14 営業日～

    細菌・放線菌 考察 (DNA)

    同定に至った経緯の文章説明を追加します。※⁴

    株

    ＋ 2,000 円

    ＋ 2 営業日～


    ※3 近隣結合法 (NJ法) 以外の系統樹作成をご希望の場合、追加費用が必要になることがあります。
    ※4 菌の特性に関する内容の記載は対応いたしかねます。

     

    ■ 簡易分子系統解析と分子系統解析の違い

    試験項目

    活用できる分野

    解析目的

    系統解析に供するデータまたは塩基配列データ

    簡易分子系統解析

    品質管理、衛生管理、スクリーニング

    検体がどの既知種近縁なのかを推定する

    当社微生物同定システム「ENKI®」登録の基準株の塩基配列データ

    分子系統解析

    学術研究、論文投稿など

    検体の分類学的位置を推定する

    主に対象分類群の最新の文献を参照した分類学的位置を推定するために必要と考えられる塩基配列データ

    ご依頼前の同意事項

    ・ 機能性表示食品の届出のため作業手順書を発行する際は、発行費用 3,000円 (税抜) をご請求します。
    ・ 多検体でご依頼の場合の目安納期は、お問い合わせ下さい。
    ・ ご依頼前の同意事項(共通)を必ずご確認下さい。
    ・ PCR時のポリメラーゼ反応エラーおよびシーケンサーのシグナル強度に起因する混合塩基の判定、ばらつきにおける試験結果への影響は考慮しておりません。
    ・ 検体の状態によりPCR増幅ができないことがあります。PCRを2回実施しても増幅産物が得られない場合、以降の試験を中止とします。PCR条件を変更しての再試験実施を希望される場合、追加費用が発生します。
    ・ バイオセーフティレベルは、細菌「日本細菌学会バイオセーフティ指針」、カビ・酵母「Atlas of clinical fungi」または「各微生物株保存機関の情報」 を採用しています。他の機関や海外の情報とは異なる場合があります。
    ・ バイオセーフティレベルは、病原体の危険度レベルに基づく分類です。結果に報告されるバイオセーフティレベルは、当社がその安全性(危険性)を保証するものではありません。
    ・ バイオセーフティレベルは、各微生物種に対し定められています。報告書で示すバイオセーフティレベルは目安であり、検体自体のバイオセーフティレベルを示すものではありません。

    ファイルをダウンロードする
    041_DNA16S_bacteria_V17.zip

    投稿 細菌DNA塩基配列解析・分子系統解析 (16S rDNA) は TechnoSuruga Laboratory Co.,Ltd. に最初に表示されました。

    ]]>         細菌形態観察および生理・生化学的性状試験 https://tecsla.jp/services/microbiological/to-researcher/bacteria/physiol-bacteria/ Tue, 07 Nov 2023 11:45:49 +0000 https://tecsla.jp/?page_id=280917 投稿 細菌形態観察および生理・生化学的性状試験 は TechnoSuruga Laboratory Co.,Ltd. に最初に表示されました。

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    細菌形態観察および生理・生化学的性状試験

    特長

    • 英国NCIMB研究所との技術提携により実現した試験

    • DNA塩基配列解析の追加試験として実施することで帰属種・近縁種との比較考察が可能

    • 好気性菌だけでなく、 嫌気性菌や放線菌にも対応

    概要

    細菌の形態学的な特徴や生理・生化学的な性状を調べ、帰属分類群を推定するために必要なデータを取得する試験です。複数の試験項目をセットにした細菌第一段階試験、細菌第二段階試験および放線菌生理・生化学的性状試験をご用意しています。

    細菌第二段階試験では、事前にDNA塩基配列解析を実施している場合、その情報から有効な生理・生化学的性状試験項目を実施しますので、より詳細に近縁種と比較することが可能となります。

    受入可能な検体

    種類

    必要量

    備考

    平板培養物

    1 枚

    当社での培養確認を必須とします。培養条件をご指示下さい。生育性や純粋性に疑義がある場合には、ご連絡します。

    液体培養物

    スラント ( 斜面培養物 )

    アンプル

    凍結保存品 ( グリセロールストック)

    1 本

    解析の流れ
    (細菌第一・第二段階試験セット (考察あり) の場合)

    • 純度確認

    • 細菌第一段階試験

    • 細菌第二段階試験

    • 文献比較

    • 総合考察

    納品内容

    試験項目

    報告内容

    付属データ

    細菌形態観察

    ・ コロニー性状、細胞形態、グラム染色性および芽胞形成能
    (培養24～48時間程度)

    ・ コロニー像
    ・ グラム染色像

    細菌第一段階試験

    ・ コロニー性状、細胞形態、運動性観察

    ・ カタラーゼ、オキシダーゼ、O/Fテストなどの生理・生化学的性状試験

    ・ 考察 (推定に至った経緯の文章説明)

    ・ 推定結果

    細菌第二段階試験

    ・ 生理・生化学的性状試験用キット (API) による炭素源の資化性、酸化／発酵性および酵素活性などの試験

    ・ 帰属種・近縁種の同定に有効な追加試験

    ・ 考察 (推定に至った経緯の文章説明)

    ・ 推定結果

    細菌第一 ・ 第二段階試験セット

    ・ 細菌第一段階 ＋ 細菌第二段階試験

    放線菌形態観察

    ・ ISP2培地上でのコロニー性状、菌糸および胞子などの細胞形態

    ・ コロニー像
    ・ 光学顕微鏡観察像

    放線菌生理 ・ 生化学的性状試験

    ・ 各種ISP培地上での生育状況、コロニー性状、色素産生、光学顕微鏡での気菌糸の観察
    ・ 生育温度、耐塩性、基質の加水分解、炭素源の資化性試験

    •  放線菌を対象とした試験では、考察や同定結果は含まれません。

    報告書サンプル

    SAMPLE／16S rDNA-500 (BLAST) 報告書v1.12のサムネイル
    SAMPLE／16S rDNA-500 (BLAST) 報告書v1.12のサムネイル

    価格・納期

    試験項目

    単位

    考察なし

    考察あり

    単価（税抜）

    目安納期

    単価（税抜）

    目安納期

    細菌形態観察

    株

    11,000 円

    8営業日

    ー

    ー

    細菌第一段階試験

    株

    24,000 円

    14営業日～

    28,000 円

    17営業日～

    細菌第二段階試験

    株

    68,000 円

    22営業日～

    73,000 円

    25営業日～

    細菌第一 ・ 第二段階試験セット

    株

    92,000 円

    22営業日～

    101,000 円

    27営業日～

    放線菌形態観察

    株

    14,000 円

    20 営業日

    ー

    ー

    放線菌生理 ・ 生化学的性状試験

    株

    87,000 円

    22営業日～

    ー

    ー

    〈オプション〉 API ZYM

    細菌第二段階試験で選択可能なオプションです。

    試験項目

    単位

    単価（税抜）

    目安納期

    API ZYM

    株

    15,000 円

    +5営業日～

    • 常用培地以外の培地や嫌気条件での培養などをご指定の場合、追加費用が必要となります。【ガイド】 追加費用のご案内をご参照下さい。
    • 多検体でご依頼の場合の目安納期は、お問い合わせ下さい。
    • 生理・生化学的性状試験用キット (API) で試験ができない分類群では、試験用の培地を個々に調製し試験を行います。培地調製には追加費用が必要となります。

    ご依頼前の同意事項

    ・ご依頼前の同意事項 (共通) を必ずご確認下さい。
    ・ 検体の生育性の有無や培養時間は、その菌の性状に依存します。当社は試験の遂行に最善の努力を払いますが、実施の確実性を保証するものではありません。
    ・ 培養条件や培養スケールの違いにより、菌株の性状が変化する可能性があります。これらの試験結果への影響について、当社は保証するものではありません。
    ・ 培養は、お客様のご指定、または当社で適当と判断した培養条件で行いますが、十分な生育が得られることを当社は保証するものではありません。
    ・ バイオセーフティレベルは、細菌「日本細菌学会バイオセーフティ指針」、カビ・酵母「Atlas of clinical fungi」または「各微生物株保存機関の情報」 を採用しています。他の機関や海外の情報とは異なる場合があります。
    ・ バイオセーフティレベルは、病原体の危険度レベルに基づく分類です。結果に報告されるバイオセーフティレベルは、当社がその安全性(危険性)を保証するものではありません。
    ・ バイオセーフティレベルは、各微生物種に対し定められています。報告書で示すバイオセーフティレベルは目安であり、検体自体のバイオセーフティレベルを示すものではありません。

    ファイルをダウンロードする
    051A_physiol_bacteria_V17.zip

    投稿 細菌形態観察および生理・生化学的性状試験 は TechnoSuruga Laboratory Co.,Ltd. に最初に表示されました。

    ]]>         細菌Premium https://tecsla.jp/services/microbiological/to-researcher/bacteria/dna-bacteria-set/ Tue, 07 Nov 2023 11:41:51 +0000 https://tecsla.jp/?page_id=280722 投稿 細菌Premium は TechnoSuruga Laboratory Co.,Ltd. に最初に表示されました。

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    細菌Premium

    特長

    • DNA塩基配列解析結果と生理・生化学的性状試験のセットメニュー

    • DNA塩基配列解析の結果を踏まえ、分類学的な特徴付けに有効な生理・生化学的性状試験項目を選定

    • 帰属種・近縁種のバイオセーフティレベル付きで報告

    概要

    16S rDNAの全長解析である「16S rDNA-Full」と「形態観察」や「生理・生化学的性状試験」などの性状試験を組み合わせたメニューです。DNA塩基配列解析のみの試験に比べ、より精度の高い帰属種・近縁種の推定が期待できます。学会発表や特許取得の際のデータ取得など、微生物株についてより詳細な情報を必要とするお客様に有効となり、当該微生物株の分類学的な特徴付けが可能です。

    受入可能な検体

    種類

    必要量

    備考

    平板培養物

    1 枚

    当社での培養確認を必須とします。培養条件をご指示下さい。生育性や純粋性に疑義がある場合には、ご連絡します。

    液体培養物

    スラント ( 斜面培養物 )

    アンプル

    凍結保存品 ( グリセロールストック)

    1 本

    解析の流れ

    • 純度確認
    • DNA抽出
    • PCR増幅
    • シーケンス
    • 塩基配列決定
    • 相同性検索
    • 分子系統解析
    • 文献調査
    • 細菌第一段階試験

    • 細菌第二段階試験

    納品内容

    試験項目

    報告内容

    付属データ

    細菌 Premium

    • 国際塩基配列データベース照合結果の上位30位

    • 当社微生物同定データベース照合結果の上位30位

    • 系統樹

    • 細菌第一段階試験結果

    • 細菌第二段階試験結果

    • 帰属種・近縁種の同定に有効な追加試験

    • 同定結果

    • 帰属種・近縁種のバイオセーフティレベル

    • コロニー像
    • 細胞形態またはグラム染色像
    • DNA 塩基配列データ
    • シーケンス波形データ

    報告書サンプル

    SAMPLE／16S rDNA-500 (BLAST) 報告書v1.12のサムネイル

    価格・納期

    試験項目

    単位

    単価 ( 税抜 )

    中間報告※

    目安納期

    細菌 Premium

    株

    135,000 円

    10 営業日

    30 営業日

    細菌 Premium/DNA 特急

    株

    146,100 円

    5 営業日

    ※ 中間報告は、当社微生物同定データベースに対し相同性検索結果の上位5位をE-メールで報告します。最終的な結論と異なる可能性があります。

    • 常用培地以外の培地や嫌気条件での培養などをご指定の場合、追加費用が必要となります。【ガイド】 追加費用のご案内をご参照下さい。
    • DNA特急は、5営業日で当社微生物同定データベースに対し相同性検索結果の上位5位をE-メールで報告します。また、一度にお受けできる検体数は8株までです。
    • 多検体でご依頼の場合の目安納期は、お問い合わせ下さい。
    • DNA塩基配列データ、シーケンス波形データ、コロニーおよび形態観察時の写真などは、報告書と一緒に納品します。

    <オプション> 総合考察

    • オプションで考察 (同定に至った経緯の文章説明) 付きに変更が可能です。

    試験項目

    報告内容

    単位

    単価（税抜）

    目安納期

    総合考察

    同定に至った経緯の文章説明を追加します。※

    株

    ＋ 11,000 円

    ＋ 2 営業日～

    ※ 菌の特性に関する内容の記載は対応いたしかねます。

    ご依頼前の同意事項

    ・ ご依頼前の同意事項 (共通) を必ずご確認下さい。
    ・ 検体の生育性の有無の確認や培養時間は、その菌の性状に依存します。当社は試験の遂行に最善の努力を払いますが、実施の確実性を保証するものではありません。
    ・ 培養条件や培養スケールの違いにより、菌株の性状が変化する可能性があります。これらの試験結果への影響について、当社は保証するものではありません。
    ・ 培養は、お客様のご指定、または当社で適当と判断した培養条件で行いますが、十分な生育が得られることを当社は保証するものではありません。
    ・ バイオセーフティレベルは、細菌「日本細菌学会バイオセーフティ指針」、カビ・酵母「Atlas of clinical fungi」または「各微生物株保存機関の情報」 を採用しています。他の機関や海外の情報とは異なる場合があります。
    ・ バイオセーフティレベルは、病原体の危険度レベルに基づく分類です。結果に報告されるバイオセーフティレベルは、当社がその安全性(危険性)を保証するものではありません。
    ・ バイオセーフティレベルは、各微生物種に対し定められています。報告書で示すバイオセーフティレベルは目安であり、検体自体のバイオセーフティレベルを示すものではありません。
    ・ PCR時のポリメラーゼ反応エラーおよびシーケンサーのシグナル強度に起因する混合塩基の判定、ばらつきにおける試験結果への影響は考慮しておりません。
    ・ 検体の状態によりPCR増幅ができないことがあります。PCRを2回実施しても増幅産物が得られない場合、以降の試験を中止とします。PCR条件を変更しての再試験実施を希望される場合、追加費用が発生します。

    ファイルをダウンロードする
    031_iden-set_bacteria (Premium)_V16.zip

    投稿 細菌Premium は TechnoSuruga Laboratory Co.,Ltd. に最初に表示されました。

    ]]>         その他追加試験 (細菌) https://tecsla.jp/services/microbiological/to-researcher/bacteria/others-bacteria/ Tue, 07 Nov 2023 11:41:02 +0000 https://tecsla.jp/?page_id=279227 投稿 その他追加試験 (細菌) は TechnoSuruga Laboratory Co.,Ltd. に最初に表示されました。

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    その他追加試験 (細菌)

    概要

    微生物株の耐熱性試験、至適生育条件確認試験が可能です。以下の試験の他にも、ご要望に応じた試験を提案します。お気軽にお問い合わせ下さい。

    • 耐熱性試験 (定性)

      100°C以下のご指定の条件による加熱処理後、寒天平板培地上での生育の有無から耐熱性の有無を判定する試験です。食品衛生検査指針では、耐熱性芽胞の有無は沸騰水中で10分加熱後の生育性を確認することとされています。その一方で、耐熱性試験を行う際には、食品の製造条件などの現場の状況を考慮した加熱条件で耐熱性試験を行うことが好ましいとされています。ご希望の際には、試験の条件をご相談下さい。

    • 至適生育条件確認試験 (定性)

      温度、pH、NaCl濃度などの生育条件に対し任意の5段階の培養条件で微生物株の至適な生育条件を確認します。試験条件についてはご指定下さい。

      至適生育条件確認試験 (5段階の条件) の一例
      温度：15℃、20℃、25℃、30℃、35℃
      pH：pH 2、pH 4、pH 6、pH 8、pH 10

    受入可能な検体

    試験項目

    種類

    必要量

    備考

    耐熱性試験 ( 定性)
    至適生育条件確認試験 ( 定性)

    平板培養物

    1 枚

    当社での培養確認を必須とします。培養条件をご指示下さい。
    生育性や純粋性に疑義がある場合には、ご連絡します。

    液体培養物

    スラント ( 斜面培養物)

    アンプル

    凍結保存品 ( グリセロールストック)

    1 本

    価格・納期

    試験項目

    単位

    単価（税抜）

    目安納期

    耐熱性試験 ( 定性 ・ 1 条件 )

    株

    13,000 円

    10 営業日

    至適生育条件確認試験 ( 定性)

    温度 (5 条件)

    株

    25,000 円

    10営業日

    pH/NaCl 濃度 (5 条件)

    25,000 円

    12営業日

    ・ 常用培地以外の培地や嫌気条件での培養などをご指定の場合、追加費用が必要となります。【ガイド】追加費用のご案内をご参照下さい
    ・ 多検体でご依頼の場合の目安納期は、お問い合わせ下さい。

    ご依頼前の同意事項

    ・ ご依頼前の同意事項(共通)を必ずご確認下さい。
    ・ 検体の生育性の有無や培養時間は、その菌の性状に依存します。当社は試験の遂行に最善の努力を払いますが、実施の確実性を保証するものではありません。
    ・ 培養条件や培養スケールの違いにより、菌株の性状が変化する可能性があります。これらの試験結果への影響について、当社は保証するものではありません。
    ・ 培養は、お客様のご指定、または当社で適当と判断した培養条件で行いますが、十分な生育が得られることを当社は保証するものではありません。
    ・ バイオセーフティレベルは、細菌「日本細菌学会バイオセーフティ指針」、カビ・酵母「Atlas of clinical fungi」または「各微生物株保存機関の情報」 を採用しています。他の機関や海外の情報とは異なる場合があります。
    ・ バイオセーフティレベルは、病原体の危険度レベルに基づく分類です。結果に報告されるバイオセーフティレベルは、当社がその安全性(危険性)を保証するものではありません。
    ・ バイオセーフティレベルは、各微生物種に対し定められています。報告書で示すバイオセーフティレベルは目安であり、検体自体のバイオセーフティレベルを示すものではありません。

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    051B-2_physiol_bacteria_(others)_V16.zip

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    ]]>         recA遺伝子解析（Lactiplantibacillus plantarumグループ） https://tecsla.jp/services/microbiological/to-researcher/bacteria/dna-fucutional-bacteria_reca/ Mon, 06 Nov 2023 23:45:00 +0000 https://www.tecsrg.co.jp/?page_id=287829 投稿 recA遺伝子解析（Lactiplantibacillus plantarumグループ） は TechnoSuruga Laboratory Co.,Ltd. に最初に表示されました。

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    recA遺伝子解析（Lactiplantibacillus plantarumグループ）

    特長

    • 16S rDNAで種の識別が困難なLactiplantibacillus plantarumグループの同定に有効

    • 近隣結合法 (NJ法) 、最節約法 (MP法) 、最尤法 (ML法) から選択可能

    概要

    Lactiplantibacillus plantarumグループに含まれる菌種間では16S rDNA 塩基配列の差異が小さく、特にL. plantarumとL. pentosusの識別は非常に困難です。しかし、機能遺伝子であるrecA 遺伝子を解析することによりL. plantarumとL. pentosus の識別が可能です。

    受入可能な検体

    種類

    必要量

    備考

    平板培養物

    1 枚

    当社での培養確認を必須とします。培養条件をご指示下さい。
    生育性や純粋性に疑義がある場合には、ご連絡します。

    液体培養物

    スラント ( 斜面培養物 )

    アンプル・凍結保存品 ( グリセロールストック)

    1 本

    解析の流れ

    • 純度確認

    • DNA抽出

    • PCR増幅

    • シーケンス

    •  塩基配列決定

    •  分子系統解析

    納品内容

    試験項目

    報告内容

    付属データ

    recA遺伝子解析（Lactiplantibacillus plantarum）

    ・国際塩基配列データベース照合結果の上位30位
    ・分子系統解析に使用した配列の登録情報一覧
    ・系統樹
    ・考察 (同定に至った経緯の文章説明) ＋ 同定結果

    ・ 分子系統樹ファイル
    (PowerPoint)
    ・ DNA塩基配列データ
    ・ シーケンス波形データ

    価格・納期

    試験項目

    単位

    単価（税抜）

    目安納期

    recA遺伝子解析（Lactiplantibacillus plantarum）

    式

    64,000 円

    15営業日～

    ご依頼前の同意事項

    ・ ご依頼前の同意事項 (共通) を必ずご確認下さい。
    ・ PCR時のポリメラーゼ反応エラーおよびシーケンサーのシグナル強度に起因する混合塩基の判定、ばらつきにおける試験結果への影響は考慮しておりません。
    ・ 検体の状態によりPCR増幅ができないことがあります。PCRを2回実施しても増幅産物が得られない場合、以降の試験を中止とします。PCR条件を変更しての再試験実施を希望される場合、追加費用が発生します。
    ・ バイオセーフティレベルは、細菌「日本細菌学会バイオセーフティ指針」、カビ・酵母「Atlas of clinical fungi」または「各微生物株保存機関の情報」 を採用しています。他の機関や海外の情報とは異なる場合があります。
    ・ バイオセーフティレベルは、病原体の危険度レベルに基づく分類です。結果に報告されるバイオセーフティレベルは、当社がその安全性(危険性)を保証するものではありません。
    ・ バイオセーフティレベルは、各微生物種に対し定められています。報告書で示すバイオセーフティレベルは目安であり、検体自体のバイオセーフティレベルを示すものではありません。

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    048_recA_bacteria_V2.zip

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    ]]>         鉄細菌　顕微鏡観察 https://tecsla.jp/services/microbiological/to-researcher/bacteria/iron-bacteria/ Sat, 14 Oct 2023 07:56:58 +0000 https://tecsla.jp/?page_id=280743 投稿 鉄細菌　顕微鏡観察 は TechnoSuruga Laboratory Co.,Ltd. に最初に表示されました。

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    鉄細菌　顕微鏡観察

    特長

    • 典型的な鉄細菌として知られるGallionella属およびLeptothrix属などを検体から直接顕微鏡観察

    • 特徴的な細胞形態を捉えた顕微鏡写真付きで報告

    概要

    水中の溶存鉄や溶存マンガンを酸化し、菌体の内外に沈積する能力をもった一群の細菌は「鉄バクテリア」または「鉄細菌」と呼ばれています。これら鉄細菌などを含めた糸状微生物 (主に糸状細菌) は、溶存鉄を含む地下水が湧き出ている場所から検出されます。また、微生物腐食、活性汚泥のバルキング (膨化) や生物膜による閉塞の原因生物となり、排水などの生物的処理施設を維持管理するうえで問題となることが知られています。
    本試験では、水試料 (肉眼で茶褐色の沈殿物が認められるような検体を含む) などを中心に、鉄細菌を光学顕微鏡による観察で識別します。下水試験方法 (2012年版) やASTM D932-20 (2020)※ などを参考に、グラム染色および無染色による観察 (微分干渉観察など) を行います。

    ※ ASTM D932-20 (2020) は失効しています。最新版を参考とするものではありません。

    報告書サンプル

    SAMPLE／16S rDNA-500 (BLAST) 報告書v1.12のサムネイル

    価格・納期

    試験項目

    単位

    単価（税抜）

    目安納期

    鉄細菌顕微鏡観察

    検体

    20,000 円

    10営業日

    • 典型的な鉄細菌として知られるグループ (Gallionella属, Leptothrix属など) においても、検体の状態によっては観察が困難な場合があります。
    • 鉄細菌のリアルタイムPCR解析は、「環境 リアルタイムPCR解析 (定量)」をご参照下さい。

    ご依頼前の同意事項

    ・ ご依頼前の同意事項 (共通) を必ずご確認下さい。

    ファイルをダウンロードする
    051A_physiol_bacteria_V17.zip

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    ]]>         Bacillus cereus group Multiplex PCR 試験 https://tecsla.jp/services/microbiological/to-researcher/bacteria/cereus-test/ Sun, 07 Nov 2021 11:45:42 +0000 https://tecsla.jp/?page_id=280932 投稿 Bacillus cereus group Multiplex PCR 試験 は TechnoSuruga Laboratory Co.,Ltd. に最初に表示されました。

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    Bacillus cereus group Multiplex PCR 試験

    概要

    B. cereus groupは、B. anthracis ( 炭疽菌) やB. cereus (セレウス菌) といったバイオセーフティーや感染症の予防および感染症の患者に対する医療に関する法律 (感染症法) の観点できわめて重要な菌種が含まれる微生物群です。しかしながら、B. cereus groupに含まれる菌種は16S rDNA塩基配列や形態学的特徴、生理・生化学的性状が類似していることがわかっています。また、近年、B. cereus groupに含まれる新種が多く報告され、16S rDNA塩基配列解析による種の識別が困難です。当社では、B. cereus group内の種の識別について、以下の試験項目を提供しています。

    試験項目

    目的

    B. cereus group Multiplex PCR 試験

    B. anthracis、B. cereus の可能性が高いのか、それ以外の種の可能性が高いのかを推定します。また、特定の毒素遺伝子を保有するか否かを推定します。

    • B. cereus group Multiplex PCR 試験

      15種類のプライマーを含む、2種のプライマーセットを組み合わせた試験により検体のB. anthracis、B. cereus への帰属の可能性、毒素遺伝子の有無が推定できる他、B. anthracis、B. cereus 以外であった場合は、帰属候補種が推定できます。検体がどの菌群に帰属するのかおよび下痢毒素遺伝子保有の有無を推定することができます。

    レーン番号 M:

    陽性対照 ( マーカー )

    レーン番号 1:

    SIIDxxxxx—01

    レーン番号 2:

    SIIDxxxxx—02

    レーン番号 3:

    SIIDxxxxx—03

    レーン番号 4:

    SIIDxxxxx—04

    レーン番号 5:

    SIIDxxxxx—05

    レーン番号 6:

    SIIDxxxxx—06

    レーン番号 N:

    陰性対照 ( 滅菌水 )

    レーン番号 M:

    陽性対照 ( マーカー )

    レーン番号 1:

    SIIDxxxxx—01

    レーン番号 2:

    SIIDxxxxx—02

    レーン番号 3:

    SIIDxxxxx—03

    レーン番号 4:

    SIIDxxxxx—04

    レーン番号 5:

    SIIDxxxxx—05

    レーン番号 6:

    SIIDxxxxx—06

    レーン番号 N:

    陰性対照 ( 滅菌水 )

    価格・納期

    試験項目

    単位

    単価（税抜）

    目安納期

    B. cereus group Multiplex PCR 試験

    株

    46,000 円

    7営業日

    ご依頼前の同意事項

    ・ 検査、診断を目的とした試験ではありません。研究を目的とした試験です。
    ・ 検体がB. anthracis に帰属する可能性が高いことを示唆された場合、検体を即時滅菌処分します。
    ・ ご依頼前の同意事項 (共通) を必ずご確認下さい。
    ・ 検体の生育性の有無の確認や培養時間は、その菌の性状に依存します。当社は試験の遂行に最善の努力を払いますが、実施の確実性を保証するものではありません。
    ・ 培養条件や培養スケールの違いにより、菌株の性状が変化する可能性があります。これらの試験結果への影響について、当社は保証するものではありません。
    ・ 培養は、お客様のご指定、または当社で適当と判断した培養条件で行いますが、十分な生育が得られることを当社は保証するものではありません。
    ・ バイオセーフティレベルは、細菌「日本細菌学会バイオセーフティ指針」、カビ・酵母「Atlas of clinical fungi」または「各微生物株保存機関の情報」 を採用しています。他の機関や海外の情報とは異なる場合があります。
    ・ バイオセーフティレベルは、病原体の危険度レベルに基づく分類です。結果に報告されるバイオセーフティレベルは、当社がその安全性(危険性)を保証するものではありません。
    ・ バイオセーフティレベルは、各微生物種に対し定められています。報告書で示すバイオセーフティレベルは目安であり、検体自体のバイオセーフティレベルを示すものではありません。

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