検体区分（種類）

由来

検体の種類※

対象

A区分：糞便検体

ヒト

糞便

細菌 ・ アーキア、カビ・酵母の DNA

マウス、ラットなどの実験動物類

糞便、腸管内容物

ブタ、ウシ、ウマなどの家畜類

糞便、腸管内容物、ルーメン液

ニワトリなどの家禽類

糞便、腸管内容物

イヌ、ネコなどのペット類

糞便

魚類、昆虫、その他

糞便、腸管内容物

B 区分： その他生体由来検体

ヒト

（その他動物種はご相談下さい）

唾液、プラーク

皮膚拭取物

膣内拭取物

DNA 抽出物

－

PCR 増幅が確認されたDNA 抽出物

PCR 増幅が確認できたことを示す電気泳動像を必ずご提供下さい。

検体の種類

必要量

留意点および送付方法

A区分

糞便、腸管内容物、ルーメン液

気密性の高い容器

0.2 ～ 0.5 g

採取後速やかに冷凍保存、冷凍輸送

メタボロキーパー®※

採取後速やかに冷蔵保存
冷蔵輸送推奨、常温輸送可

・ メタボロキーパー®を用いてのご依頼の場合には糞便中有機酸 (短鎖脂肪酸) 分析が必要になります。

B区分

A 区分以外
口腔内容物
( 唾液、プラーク )
皮膚拭取物など

スワブ
1.5 mL チューブなど

0.2 ～ 1 mL
( 唾液 )

唾液、舌苔、 口腔粘膜、プラークを採取し、速やかに冷凍保存、冷凍輸送

綿棒やコットンなどで広範囲を拭き取った検体は、極少量の適切な溶液 (PBS、生理食塩水、滅菌水など) に移し、速やかに冷蔵保存、冷蔵輸送

DNA 抽出物

濃度 ： 10 ng/µL
容量 ： 30 µL
(1 プライマー
追加ごとに
＋ 15 µL 以上 )

抽出後速やかに冷蔵保存、冷蔵輸送

PCR 増幅が確認できたことを示す電気泳動像を必ずご提供下さい。

試験項目

内容（解析例）

単位

単価（税抜）

目安納期

リアルタイム PCR 解析 ( 定量 )

検体数 1

1 プライマーの場合

検体

45,000 円

15 営業日～

検体数 2

2 プライマーの場合

45,000 円

検体数 5

2 プライマーの場合

31,000 円

検体数 10

2 プライマーの場合

26,000 円

＜オプション＞ プライマー設計

-

式

45,000 円

＋ 10 営業日

＜オプション＞　スタンダード作製

-

式

104,000 円

お問い合わせ下さい

検体の種類

必要量

留意点および送付方法

A区分

糞便、腸管内容物、ルーメン液

気密性の高い容器

0.2 ～ 0.5 g

採取後速やかに冷凍保存、冷凍輸送

糞便採取容器 (保存液あり)あるいは「メタボロキーパー®」※

採取後速やかに冷蔵保存
冷蔵輸送推奨、常温輸送可

B区分

A 区分以外
口腔内容物
( 唾液、プラーク )
皮膚拭取物など

スワブ
1.5 mL チューブなど

0.2 ～ 1 mL
( 唾液 )

唾液、舌苔、 口腔粘膜、プラークを採取し、速やかに冷凍保存、冷凍輸送

綿棒やコットンなどで広範囲を拭き取った検体は、極少量の適切な溶液 (PBS、生理食塩水、滅菌水など) に移し、速やかに冷蔵保存、冷蔵輸送

メタフロキーパー※

(皮膚、唾液)

採取後速やかに冷蔵保存

冷蔵輸送推奨、常温輸送可

DNA 抽出物

濃度 ： 10 ng/µL
容量 ： 30 µL
(1 プライマー
追加ごとに
＋ 15 µL 以上 )

抽出後速やかに冷蔵保存、冷蔵輸送

PCR 増幅が確認できたことを示す電気泳動像を必ずご提供下さい。

試験項目

内容（解析例）

単位

単価（税抜）

目安納期

特異プライマーPCR 解析 ( 定性 )

検体数 1

1 プライマーの場合

検体

36,000 円

15 営業日～

検体数 2

2 プライマーの場合

34,000 円

検体数 2

3 プライマーの場合

38,000 円

検体数 5

5 プライマーの場合

39,000 円

＜オプション＞ プライマー設計

-

式

45,000 円

＋ 10 営業日

対象菌種（分類群）

遺伝子

備考

全真正細菌

16S

検体中に含まれる全真正細菌

全アーキア

16S

検体中に含まれる全アーキア

カビ・酵母 ITS

ITS領域

検体中に含まれるカビ・酵母

対象菌種 ( 分類群 )

遺伝子

備考

Methanobacteriaceae 科

-

ヒト腸内アーキアであるMethanobacteriaceae 科 (Methanobrevibacter およびMethanosphaera)

Methanobacteriaceae Detection Kit (Cat. No. RM-0001) 使用

対象菌種 ( 分類群 )

遺伝子

備考

Akkermansia muciniphila

16S

腸管内のムチン分解菌であるA. muciniphila

Anaerostipes 属

-

ヒト腸管内の優勢菌種であるAnaerostipes 属

Anaerostipes Detection Kit (Cat. No. RI-0017) 使用

Bacillota 門 (Firmicutes 門)

16S

ヒト ・ 動物腸管内の優勢菌であるBacillota 門(Firmicutes 門)

Bacteroidetota 門 ( Bacterioidetes 門)

16S

ヒト ・ 動物腸管内の優勢菌であるBacteroidetota 門( Bacterioidetes 門)

Bacteroidales 目

16S

ヒト ・ 動物腸管内の優勢菌であるBacteroidales 目 (Bacteroides /Phocaericola /Prevotella /Porphyromonas 属など )

Bacteroides 属

-

ヒト ・ 動物腸管内の優勢菌である旧Bacteroides 属 (Bacteroides 属および Phocaeicola 属)

Bacteroides Detection Kit (Cat. No. RI-0011) 使用

Bacteroides fragilis

-

ヒト・動物腸管内および口腔内B. fragilis

Bacteroides fragilis Detection Kit (Cat. No. RO-0003) 使用

Bifidobacterium 属

16S

ヒト腸管内の優勢乳酸菌であるBifidobacterium 属

Bifidobacterium bifidum

16S

ヒト小児腸管内の優勢菌であるB. bifidum

Bifidobacterium breve

16S

ヒト小児腸管内の優勢菌であるB. breve

Bifidobacterium longum

16S

食品中あるいは腸管内のB. longum

Bifidobacterium longum subsp. longum

tuf

食品中あるいは腸管内のB. longum subsp. longum

Bifidobacterium pseudocatenulatum

groEL

腸管内のB. pseudocatenulatum

Bilophila wadsworthia

-

胆汁により発育が促進され, β-ラクタム薬に高度耐性をもつB. wadsworthia

Bilophila wadsworthia Detection Kit (Cat. No. RI-0009) 使用

Blautia 属

-

ヒト腸管内の最優勢菌種であるBlautia 属

Blautia Detection Kit (Cat. No. RI-0008) 使用

Campylobacter 属

-

臨床細菌学的に重要な、 ヒト ・ 動物腸管内および口腔内Campylobacter 属

Campylobacter Detection Kit (Cat. No. RO-0006) 使用

Candidate Division TM7

16S

炎症性腸疾患との関わりが注目されている Candidate Division TM7

Cetobacterium 属

-

ヒト腸管内Fusobacteria 門細菌であるCetobacterium 属

Cetobacterium Detection Kit (Cat. No. RI-0016) 使用

Christensenella minuta

-

痩せ型のヒトに多いとされるC. minuta

Christensenella minuta Detection Kit (Cat. No. RI-0015) 使用

Clostridium cluster I & II

16S

ヒト ・ 動物腸管内の優勢菌種であり狭義のClostridium 属菌である Clostridium cluster I および II

Clostridium cluster IV

-

ヒト ・ 動物腸管内の優勢菌種であるClostridium cluster IV

Clostridium cluster IV Detection Kit (Cat. No. RI-0001) 使用

Clostridium cluster XI

16S

ヒト ・ 動物腸管内の優勢菌種であるClostridium cluster XI

Clostridium cluster XIV

16S

ヒト ・ 動物腸管内の優勢菌種であるClostridium cluster XIV

Clostridium cluster XV

-

ヒト ・ 動物腸管内のClostridium cluster XV

Clostridium cluster XV Detection Kit (Cat. No. RI-0002) 使用

Clostridium cluster XVI ～ XVIII

-

ヒト ・ 動物腸管内のClostridium cluster XVI、 XVII および XVIII

Clostridium cluster XVI ・ XVII ・ XVIII Detection Kit (Cat. No. RI-0006) 使用

Clostridium cluster XVIII

-

ヒト ・ 動物腸管内のClostridium cluster XVIII

Clostridium cluster XVIII Detection Kit (Cat. No. RI-0003) 使用

Clostridium perfringens ( ウェルシュ菌 )

16S

日和見感染菌であるC. perfringens ( ウェルシュ菌 )

Clostridium butyricum

-

酪酸を生成する偏性嫌気性芽胞形成グラム陽性桿菌

Clostridium butyricum Detection Kit (Cat. No. RI-0004) 使用

Clostridium leptum

-

ヒト ・ 動物腸管内のC. leptum

Clostridium leptum Detection Kit (Cat. No. RI-0007) 使用

Peptacetobacter hiranonis および Clostridium scindens

baiCD

7 α -dehydroxylase 活性を有するP. hiranonis およびC. scindens

Clostridium hylemonae およびC. scindens

baiJ

7 α -dehydroxylase 活性を有するC. hylemonae およびC. scindens

Clostridioides difficile

16S

偽膜性腸炎、 抗菌薬関連下痢症に関与するC. difficile

Coriobacteriaceae 科

16S

ヒト腸内細菌の優勢菌であるCoriobacteriaceae 科 (Atopobium /Collinsella /Eggerthella 属 )

Eggerthella 属

-

ヒト腸管内のEggerthella 属

Eggerthella Detection Kit (Cat. No. RI-0021) 使用

Enterobacteriaceae 科

16S

ヒト ・ 動物腸管内常在菌である腸内細菌科 (E.coli , Shigella etc.)

Enterococcus 属

16S

ヒト ・ 動物腸管内および環境中のEnterococcus 属

Enterococcus faecalis

-

食品中あるいは環境中のE. faecalis

Enterococcus faecalis Detection Kit (Cat. No. RF-0003) 使用

Enterococcus faecium

recA

ヒト ・ 動物腸管内および環境中のE. faecium

Escherichia coli／Shigella 属

16S

ヒト ・ 動物腸管内および環境中の大腸菌 (E.coli およびShigella 属)

Faecalibacterium prausnitzii

16S

ヒト腸管内の優勢菌種であるF. prausnitzii およびその近縁菌種

Fusicatenibacter saccharivorans

-

ヒト腸管内の優勢菌種であるF. saccharivorans

Fusicatenibacter saccharivorans Detection Kit (Cat. No. RI-0020) 使用

Fusobacteriota 門（Fusobacteria 門）

16S

臨床細菌学的に重要なヒト ・ 動物腸管内および口腔内  Fusobacteriota 門（Fusobacteria 門）

Fusobacterium 属

-

臨床細菌学的に重要な、 ヒト・ 動物腸管内および口腔内Fusobacterium 属

Fusobacterium Detection Kit (Cat. No. RO-0005) 使用

Fusobacterium varium

-

ヒト ・ 動物腸管内のF. varium

Fusobacterium varium Detection Kit (Cat. No. RI-0005) 使用

Fusobacterium nucleatum

16S

臨床細菌学的に重要なF. nucleatum

Helicobacter 属

16S

ヒト胃腸間内の常在菌であるHelicobacter 属

Klebsiella pneumoniae

-

ヒト ・ 動物腸管内および口腔内 K. pneumoniae

Klebsiella pneumoniae Detection Kit (Cat. No. RI-0014) 使用

Lacticaseibacillus casei ( Lactobacillus casei )

16S

ヒト ・ 動物腸管内のL . casei

Lacticaseibacillus casei ( Lactobacillus casei ) group

16S

ヒト ・ 動物腸管内のL . casei, L. paracasei, L. rhamnosus およびL . zeae

Lactobacillus 属

16S

ヒト ・ 動物腸管内の旧名Lactobacillus /Pediococcus /Weissella 属

Lactobacillus gasseri

-

ヒト ・ 動物腸管内のL . gasseri

Lactobacillus gasseri Detection Kit (Cat. No. RI-0010) 使用

Limosilactobacillus fermentum ( Lactobacillus fermentum )

16S

ヒト ・ 動物腸管内のL . fermentum

Limosilactobacillus mucosae (Lactobacillus mucosae )

-

ヒト ・ 動物腸管内のL . mucosae

Limosilactobacillus mucosae Detection Kit (Cat. No. RI-0019) 使用

Lancefieldella parvula
（Atopobium parvulum ）

16S

大腸がんとの関連が疑われているL. parvula （A. parvulum ）

Peptostreptococcus stomatis

-

大腸がん病巣から高頻度に検出されるP. stomatis

Peptostreptococcus stomatis Detection Kit (Cat. No. RI-0018) 使用

Parabacteroides 属

-

ヒト ・ 動物腸管内の優勢菌であるParabacteroides 属

Parabacteroides Detection Kit (Cat. No. RI-0013) 使用

Prevotella 属

-

ヒト ・ 動物腸管内および口腔内Prevotella 属

Prevotella Detection Kit (Cat. No. RO-0004) 使用

Proteus 属

16S

ヒト ・ 動物腸管内および環境中のProteus 属

Proteus mirabilis

ureA

尿路感染症に関連するP. mirabilis

Pseudomonas 属

16S

ヒト ・ 動物腸管内および環境中のPseudomonas 属

Pseudomonas aeruginosa

gyrB

ヒト ・ 動物腸管内および環境中に存在し、 緑膿菌感染症の原因となるP. aeruginosa

Roseburia／Agathobacter rectalis group

16S

ヒト ・ 動物腸管内の Roseburia/Agathobacter rectalis group

Roseburia 属

16S

ヒト腸管内の酪酸産生菌であるRoseburia 属 (R. inulinivorans 除く )

Salmonella 属

invA

ヒトや動物の消化管に生息し、 一部がヒトや動物に感染して病原性を示す Salmonella 属

Staphylococcus 属

16S

ヒト ・ 動物腸管内および環境中のStaphylococcus 属

Staphylococcus aureus

-

臨床細菌学的に重要な、 ヒト ・ 動物腸管内および口腔内S. aureus

Staphylococcus aureus Detection Kit (Cat. No. RO-0009) 使用

Streptococcus 属

-

ヒト ・ 動物腸管内 ・ 口腔内のStreptococcus 属

Streptococcus Detection Kit (Cat. No. RO-0001) 使用

Streptococcus bovis

16S

ルーメン細菌であるS. bovis (S. equinus)

Sutterella 属

-

胆汁耐性菌でAutism-associated bacteria として議論されているSutterella 属

Sutterella Detection Kit (Cat. No. RI-0012) 使用

Thomasclavelia ramosa
(Clostridium ramosum)

-

ヒト ・ 動物腸管内の T. ramosa

Thomasclavelia ramosa Detection Kit (Cat. No. RI-0022) 使用

Veillonella 属

-

ヒト ・ 動物腸管内および口腔内常在菌であるVeillonella 属

Veillonella Detection Kit (Cat. No. RO-0007) 使用

Verrucomicrobiota 門
（Verrucomicrobia 門）

-

ヒト ・ 動物腸管内の Verrucomicrobiota 門 （Verrucomicrobia 門）

対象菌種 ( 分類群 )

遺伝子

備考

Actinomyces 属

-

ヒト ・ 動物腸管内および口腔内常在菌であるActinomyces 属

Actinomyces Detection Kit (Cat. No. RO-0008) 使用

Aggregatibacter actinomycetemcomitans

-

歯周病の原因菌として注目されているA. actinomycetemcomitans

Aggregatibacter actinomycetemcomitans Detection Kit (Cat. No. RO-0011) 使用

Bacteroides fragilis

-

ヒト ・ 動物腸管内および口腔内B. fragilis

Bacteroides fragilis Detection Kit (Cat. No. RO-0003) 使用

Campylobacter 属

-

臨床細菌学的に重要な、 ヒト ・ 動物腸管内および口腔内Campylobacter 属

Campylobacter Detection Kit (Cat. No. RO-0006) 使用

Candidate Division TM7

16S

歯周炎との関わりが注目されている Candidate Division TM7

Fusobacterium 属

-

臨床細菌学的に重要な、 ヒト ・ 動物腸管内および口腔内Fusobacterium 属

Fusobacterium Detection Kit (Cat. No. RO-0005) 使用

Fusobacterium nucleatum

16S

歯周病の原因菌として注目されているF. nucleatum

Leptotrichia 属

-

口腔内常在菌であるLeptotrichia 属

Leptotrichia Detection Kit (Cat. No. RO-0012) 使用

Prevotella 属

-

ヒト ・ 動物腸管内および口腔内Prevotella 属

Prevotella Detection Kit (Cat. No. RO-0004) 使用)

Prevotella intermedia

16S

ヒト口腔内常在菌であるP. intermedia

Porphyromonas gingivalis

-

ヒトの歯肉溝に生息し、 歯周病の原因菌として注目されているP. gingivalis

Porphyromonas gingivalis Detection Kit (Cat. No. RO-0010) 使用

Streptococcus 属

-

ヒト ・ 動物腸管内 ・ 口腔内のStreptococcus 属

Streptococcus Detection Kit (Cat. No. RO-0001) 使用

Streptococcus mutans

-

う蝕に関与するS. mutans

Streptococcus mutans Detection Kit (Cat. No. RO-0002) 使用

Streptococcus intermedius

-

ヒト口腔内常在菌であるS. intermedius

Streptococcus intermedius Detection Kit (Cat. No. RO-0015) 使用

Streptococcus oralis

gtfR

ヒト口腔内常在菌であるS. oralis

Staphylococcus aureus

-

臨床細菌学的に重要な、 ヒト ・ 動物腸管内および口腔内S. aureus

Staphylococcus aureus Detection Kit (Cat. No. RO-0009) 使用

Treponema denticola

-

歯周病の原因菌として注目されているT. denticola

Treponema denticola Detection Kit (Cat. No. RO-0013) 使用

Tannerella forsythia

-

歯周病の原因菌として注目されているT. forsythia

Tannerella forsythia Detection Kit (Cat. No. RO-0014) 使用

Veillonella 属

-

ヒト ・ 動物腸管内および口腔内常在菌であるVeillonella 属

Veillonella Detection Kit (Cat. No. RO-0007) 使用

対象菌種 ( 分類群 )

遺伝子

備考

Acinetobacter 属

16S

ヒト腸内 ・ 皮膚の常在菌であるAcinetobacter 属

Cutibacterium acnes

grpE

皮膚の常在菌であるC. acnes

Staphylococcus aureus

-

臨床細菌学的に重要な、ヒト・動物腸管内および口腔S. aureus

Staphylococcus aureus Detection Kit （Cat. No. RO-009）使用

Staphylococcus epidermidis

gmk

表皮ブドウ球菌であるS. epidermidis

Staphylococcus warneri

sodA

皮膚の常在菌であるS. warneri

対象菌種（分類群）

遺伝子

備考

Gardnerella vaginalis

-

細菌性膣症の原因菌として知られているG. vaginalis

Gardnerella vaginalis Detection Kit (Cat. No. RV-0001) 使用

対象菌種（分類群）

遺伝子

備考

Aeromonas 属

-

河川水、 泥土、 魚や貝類から分離され、 下痢症と関連するAeromonas 属

Aeromonas Detection Kit (Cat. No. RE-0001) 使用

Legionella 属

-

水系、 土壌など広く自然界に分布するLegionella 属

Legionella Detection Kit (Cat. No. RE-0005) 使用

Legionella pneumophila

mip

水系、 土壌など広く自然界に分布し、 レジオネラ肺炎の原因菌であるL. pneumophila

Listeria 属

prsA

食品中あるいは環境中のListeria 属

Listeria monocytogenes

hlyA

食品中あるいは環境中のL. monocytogenes

Serratia marcescens

gyrB

水、 土壌、 牛乳などから腐生菌として検出されるS. marcescens

Vibrio 属

ftsZ

自然界では海水などの水中に多く存在する環境中の常在細菌であるVibrio 属

Vibrio vulnificus

vvh

海水や海泥、 そこに生息する魚介類に広く分布し、 感染性胃腸炎や重篤な敗血症の原因になるV. vulnificus

Vibrio parahaemolyticus

tlh

海水に広く存在し、食中毒の原因菌である腸炎ビブリオV.parahaemolyticus

対象菌種 ( 分類群 )

遺伝子

備考

Alicyclobacillus 属

-

耐熱性好酸性菌であるAlicyclobacillus 属

Alicyclobacillus Detection Kit (Cat. No. RF-0002) 使用

Bacillus subtilis

-

食品中あるいは環境中のB. subtilis

Bacillus subtilis Detection Kit (Cat. No. RF-0009) 使用

Bifidobacterium animalis subsp. lactis

16S-23S

食品中あるいは環境中のB. animalis subsp. lactis

Bifidobacterium longum

16S

食品中あるいは環境中のB. longum

Enterococcus faecalis

-

食品中あるいは環境中のE. faecalis

Enterococcus faecalis Detection Kit (Cat. No. RF-0003) 使用

Lacticaseibacillus rhamnosus (Lactobacillus rhamnosus )

16S

食品中あるいは環境中のL . rhamnosus

Lactiplantibacillus paraplantarum (Lactobacillus paraplantarum )

-

食品中のL . paraplantarum

Lactiplantibacillus paraplantarum Detection Kit (Cat. No. RF-0008) 使用

Lactiplantibacillus plantarum (Lactobacillus plantarum )

recA

食品中あるいは環境中のL . plantarum

Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus

-

食品中のL . delbrueckii subsp. bulgaricus

Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus Detection Kit (Cat. No. RF-0005) 使用

Lactobacillus helveticus

-

食品中のL . helveticus

Lactobacillus helveticus Detection Kit (Cat. No. RF-0007) 使用

Lactococcus lactis

-

食品中あるいは環境中のL . lactis

Lactococcus lactis Detection Kit (Cat. No. RF-0010) 使用

Lactococcus cremoris

-

食品中あるいは環境中のL . cremoris

Lactococcus cremoris Detection Kit (Cat. No. RF-0011) 使用

Leuconostoc mesenteroides

-

食品中あるいは環境中のL. mesenteroides

Leuconostoc mesenteroides Detection Kit (Cat. No. RF-0012) 使用

Levilactobacillus brevis (Lactobacillus brevis )

-

食品中のL . brevis

Levilactobacillus brevis Detection Kit (Cat. No. RF-0006) 使用

Listeria 属

prsA

食品中あるいは環境中のListeria属

Listeria monocytogenes

hlyA

食品中あるいは環境中のL. monocytogenes

Pediococcus pentosaceus

recA

食品中あるいは環境中のP. pentosaceus

Saccharomyces cerevisiae

nmd3

食品中あるいは環境中のS. cerevisiae

Streptococcus thermophilus

-

食品中のS. thermophilus

Streptococcus thermophilus Detection Kit (Cat. No. RF-0004) 使用

Tetragenococcus halophilus

16S

食品中あるいは環境中のT. halophilus

Weizmannia coagulans ( Bacillus coagulans )

16S

食品中あるいは環境中のW. coagulans

芽胞菌

spo0A

食品中あるいは環境中の芽胞菌 (Bacillus属 /Geobacillus属 /Anoxybacillus属 etc)

酢酸菌

-

酢酸菌であるAcetobacter /Acidomonas /Gluconacetobacter/ Gluconobacter /Kozakia/Tanticharoenia 属

Acetic acid bacteria Detection Kit (Cat. No. RF-0001) 使用

対象菌種 ( 分類群 )

遺伝子

備考

メタン菌

mcrA

メタン生成菌が有するメタン酵素遺伝子 (mcrA)

Methanothrix 属

16S

メタン発酵漕内の優占菌種であるMethanothrix 属

Methanosarcina 属

16S

メタン発酵漕内の優占菌種であるMethanosarcina 属

Methanoculleus 属

16S

メタン発酵漕内の優占菌種であるMethanoculleus 属

Methanobacteriaceae 科

-

ヒト腸内アーキアであるMethanobacteriaceae 科（Methanobrevibacter 属およびMethanosphaera 属）

Methanobacteriaceae Detection Kit (Cat. No. RM-0001) 使用

Methanolobus 属

16S

メタン菌であるMethanolobus 属

Methanospirillum 属

-

メタン菌であるMethanospirillum 属

Methanospirillum Detection Kit (Cat. No. RM-0002) 使用

Methanomethylovorans 属

-

メタン菌であるMethanomethylovorans 属

Methanomethylovorans Detection Kit (Cat. No. RM-0003) 使用

対象菌種（分類群）

遺伝子

備考

Dehalobacter 属

16S

検体中に含まれるDehalobacter 属

Dehalococcoides 属

16S

検体中に含まれるDehalococcoides 属

Dehalococcoides 属

bvcA

DCEs あるいは VC からエチレンへの分解酵素遺伝子であるbvcA遺伝子

Dehalococcoides 属

vcrA

DCEs あるいは VC からエチレンへの分解酵素遺伝子であるvcrA遺伝子

Dehalococcoides 属

tceA

TCE から塩化ビニル VC への分解酵素遺伝子であるtceA遺伝子

対象菌種（分類群）

遺伝子

備考

Acidithiobacillus thiooxidans

16S

硫黄酸化に関係する A. thiooxidans

Sulfobacillus 属

16S

バイオリーチングで使用されるSulfobacillus 属

対象菌種 ( 分類群 )

遺伝子

備考

硫酸還元菌

dsrB

金属の微生物腐食に関与する硫酸塩還元菌が有する硫酸塩還元酵素遺伝子 (dsrB)

鉄細菌 (Leptothrix 属およびSphaerotilus 属)

-

金属の微生物腐食に関与する鉄細菌である Leptothrix 属およびSphaerotilus 属

Leptothrix/Sphaerotilus Detection Kit (Cat. No. RE-0002) 使用

鉄細菌 (Gallionella 属およびSideroxydans 属)

-

金属の微生物腐食に関与する鉄細菌である Gallionella 属およびSideroxydans 属

Gallionella/Sideroxydans Detection Kit (Cat. No. RE-0003) 使用

鉄細菌 (Prolixibacter 属)

-

金属の微生物腐食に関与する鉄細菌であるProlixibacter 属

Prolixbacter Detection Kit (Cat. No. RE-0006) 使用

鉄酸化細菌 (Leptospirillum 属)

gyrB

金属の微生物腐食に関与する鉄酸化細菌であるLeptospirillum 属

硫黄酸化細菌

soxB

金属の微生物腐食に関与する硫黄酸化細菌が有する硫黄酸化酵素遺伝子 (soxB)

硫黄酸化細菌 (Acidithiobacillus 属)

16S

soxB遺伝子を有しない硫黄酸化細菌であるAcidithiobacillus 属

メタン菌

mcrA

金属の微生物腐食に関与するメタン生成菌が有するメタン酵素遺伝子 (mcrA)

対象菌種 ( 分類群 )

遺伝子

備考

アンモニア酸化細菌

amoA

アンモニア酸化細菌が有するアンモニア酸化酵素遺伝子 (amoA)

アンモニア酸化アーキア

arch-amoA

アンモニア酸化アーキアが有するアンモニア酸化酵素遺伝子 (arch-amoA)

Anammox 細菌

hzo

汚水処理の分野で注目されている嫌気的アンモニア酸化 (Anammox) 反応を担うAnammox細菌

亜硝酸還元菌

nirS

亜硝酸還元菌が有する亜硝酸還元酵素遺伝子 (nirS)

亜硝酸還元菌

nirK

亜硝酸還元菌が有する亜硝酸還元酵素遺伝子 (nirK)

窒素固定細菌

nifH

窒素固定細菌が有する窒素固定に関連するニトロゲナーゼ遺伝子 (nifH)

亜酸化窒素還元菌

nosZ

亜酸化窒素還元菌が有する亜酸化窒素還元酵素遺伝子 (nosZ)

亜硝酸酸化細菌 (Nitrobacter 属)

16S

亜硝酸酸化細菌であるNitrobacter 属

亜硝酸酸化細菌 (Nitrobacter 属)

norB

亜硝酸酸化細菌であるNitrobacter属が有する亜硝酸酸化還元酵素遺伝子 (norB)

亜硝酸酸化細菌 (Nitrospira 属)

16S

亜硝酸酸化細菌であるNitrospira 属

Comammox Nitrospira clade A

amoA

完全アンモニア酸化と考えられていNitrospira 菌

Comammox Nitrospira clade B

amoA

完全アンモニア酸化と考えられているNitrospira 菌

Pseudomonas aeruginosa

gyrB

窒素循環において重要な役割を担うP. aeruginosa

対象菌種（分類群）

遺伝子

備考

メタン酸化細菌

pmoA

メタン酸化細菌が有するメタンモノオキシゲナーゼ遺伝子 (pmoA)

水素産生菌

hydA

検体中に含まれる水素産生菌

Candidate Division TM7

16S

活性汚泥、 環境水などに存在するCandidate Division TM7

Thiothrix 属

-

活性汚泥中の糸状性細菌であるThiothrix 属

Thiothrix Detection Kit (Cat. No. RE-0004) 使用

Alphaproteobacteria 綱

16S

検体中に含まれるAlphaproteobacteria 綱