特長

概要

細菌、カビ、酵母のタンパク質マススペクトルを取得し、データベースと照合することで、検体の帰属種・近縁種を同定します。MALDI-TOF M S法は、迅速性やコストの低さから臨床・食品・製薬など様々な分野で普及が進んでいます。
細菌および酵母は、当社営業日の午前中に到着し、検体が純化された平板培養物、または解析を実施するコロニーやカテゴリーが明確であった場合、ご送付検体より直接解析を行い、即日報告が可能です。
カビは、タンパク質抽出を効率よく行うために液体培地での培養が必須となりますが、検体受領から培養を含めて、2〜4日で報告が可能です。また、DNA塩基配列解析に比べ安価ですので、コストを重視されるお客様におすすめです。

〈こんな方におすすめです〉

• まとまった検体数で同定を行いたいけれど、コストを抑えたい。
• DNA塩基配列解析を考えているが、事前にスクリーニングとして利用したい。

受入可能な検体

検体到着予定日の前営業日17:00までに依頼書をE- メールにてお送り下さい
検体の状態によっては即日報告できない場合があります。下表をご確認の上、検体をご送付ください。

• カテゴリー変更やコンタミネーションなどに起因し、解析対象が試験当日の12:00までに確定できない場合、即日報告できません。
• １日の報告件数は10株を上限とします。10株を超える場合は翌日以降のご報告となります。その際は優先順位をご連絡ください。

※1 純粋な単一コロニーが認められない検体、液体培養物、混釈培養物、ペトリフィルム、選択培地で培養した検体などは直接解析できません。当社にて必要に応じて平板塗抹による再培養（有償）、または単離作業（有償）を行い、その後解析となります。再培養、単離作業を行う場合、MALDI微生物同定試験とは別に納期を必要とします。
※2 グルーピング (コロニー性状による同種／別種の判断) は有償での対応となります。MALDI微生物同定試験とは別に納期を必要とします。
※3 培養後、大幅に時間が経過している検体は解析に適しません。生育が確認 (生育の目安は直径1～2mm程度のコロニーが確認できる状態)でき次第、速やかに微生物株をお送り下さい。
※4 当社にて解析前に培養を行いますので、培養後時間が経過している微生物株でも生育が認められれば解析可能です。

解析の流れ

納品内容

報告書サンプル

使用データベースと対象微生物

「Main Spectra(MSP)」を基本コンセプトとし、各微生物株を複数回測定して各ピーク(分子量)とその強度の平均値を算出取得しています。マススペクトルのうち、検出頻度の低いピークはノイズとして除去して検出頻度の高い特徴的なピークのみを用いてデータベースを構成しています。同一菌種でも複数株のマススペクトルデータが登録されているため、菌株間でマススペクトルパターンに多様性がある場合でも正確な同定が可能とされています。

価格・納期

年間契約割引( 年間150 株以上) もご用意しております。

※1 報告日が休業日の場合、翌営業日の報告となります。
※2 培養(目安日数:2〜3日)において生育が充分と判断した日に試験を開始します(翌営業日報告)。試験の可否判断は、当社に一任下さい。
※3 原則18:00までに報告しますが、状況によっては18:00以降の報告となる場合があります。また報告時間の指定(例：「15:00までに報告を希望」など)には対応できません。

関連ページ

２，DNA塩基配列解析（通常納期）をご検討の方には、以下の試験項目がございます。

特長

※1　カビ形態Rapidは除く。
※2　当社微生物同定データベースに対する相同性検索結果を報告します。
※3　ENKI BLAST Rapid解析は対象外となります。

概要

医薬品や食品・飲料メーカーなどで衛生管理を担当され、特に迅速性を要求されるお客様におすすめです。
DNA塩基配列解析には、当社が開発した微生物同定システム「ENKI®」を使用します。
Rapid解析 (4営業日報告) は、当社の微生物同定データベースおよび国際塩基配列データベース (INSD：DDBJ/ENA/GenBank) に対して相同性検索を行い、その結果に基づく簡易分子系統解析から帰属種・近縁種を同定します。
ENKI BLAST Rapid解析は、当社の微生物同定データベースに対する相同性検索結果を2営業日で報告します (細菌および酵母が対象となります)。
カビ形態Rapid は、顕微鏡観察により識別可能なレベル(基本的に属レベル)までの分類群を同定します。

受入可能な検体

検体到着予定日の前営業日17:00 までに依頼書をE- メールでお送り下さい。

解析の流れ
(カビ形態Rapidの場合)

納品内容

価格・納期

※1 中間報告は、当社微生物同定データベースに対し相同性検索結果の上位5位をE-メールで報告します。最終的な結論と異なる可能性があります。
※2 追加の簡易分子系統解析 (8,000円 (税抜) /株、納期＋5営業日) を行うことで、Rapid解析と同内容の報告が可能です。
※3 1回目のPCRでDNA増幅産物が得られない場合には、納期を1営業日延長いたします。延長が判明した時点でお客様にはメールにてご案内いたしますが、当該メールへのご返信を待たずに2回目のPCRを実施いたします。
※4 2回目のPCRでDNA増幅産物が得られない場合は、その時点で作業を中止させていただきます。

関連ページ

２，DNA塩基配列解析（通常納期）をご検討の方には、以下の試験項目がございます。

特長

概要

DNA塩基配列解析では、国際塩基配列データベース (INSD：DDBJ/ENA/GenBank) の利用がほとんどですが、膨大なDNA塩基配列データが蓄積されているために、微生物の同定に有効なDNA塩基配列データを選択するには多大な手間と時間を要します。また、微生物分類学の専門知識がなければ、微生物の同定が難しいケースが多々あります。
当社では国立遺伝学研究所 生命情報・DDBJ (DNA Data Bank of Japan) センターのご支援により、微生物同定に有効なデータを収集したDNAデータベース「微生物同定データベース」を構築し、当社が開発した系統解析を簡単に行うことができる微生物同定ソフトウェア「ENKI®」とあわせて販売しています。
本システムは、解析メニューのボタンが解析手順に沿って並んでいますので、専門知識のないお客様でも簡単に操作可能です。また、解析したい塩基配列を複数選択し、相同性検索から系統解析までを自動で行うことも可能です。
微生物同定データベースは、学術論文などを参考に精査したDNA塩基配列データで構成されています。バージョンアップは定期的に行い、新種提唱された種の基準株やタイプ由来株のDNA塩基配列データを追加するほか、国際塩基配列データベースに未登録の種の基準株やタイプ由来株については、必要に応じて当社が独自にDNA塩基配列を解析し、微生物同定データベースに追加しています。

■分かり易い相同性検索結果
学名、株名、国際塩基配列データベースのアクセッション番号、相同率、バイオセーフティーレベルが表示されます。検索結果をPDF形式で保存可能です。

■近縁種の同定が容易
系統樹を描くことで、相同率の比較だけでは理解しにくい近縁種との系統関係を明確にします。系統樹はPDFなどのファイルで保存可能です。

解析の流れ

使用方法の動画

製品仕様

動作環境：
日本語版 Windows®10, 11 /64bit / CPU 2GHz以上 /メモリー 2GB以上 / HDD 1GB以上

使用制限：
「ENKI®」は論文発表以外の研究または品質管理目的のみ利用可能です。
医療や臨床診断、解析受託目的ではご利用いただけません。

機能一覧

価格

※ 国際塩基配列データベースを利用した相同性検索は、インターネット接続ができないPCではご利用できません。

・ 微生物同定データベースの更新 (アップデート) には、最新版のデータベースの購入が必要です。
・ BAは細菌を意味し、FUはカビ・酵母、きのこを意味します。
・ DBはデータベースを意味し、DLは年間ライセンスを意味します。
・ DB-BAには、16S rDNA領域のデータベースを収録しています。
・ DB-FUには、rDNAのITS領域と28S (26S) rDNA領域（主にD1/D2領域）の2種類のデータベースを収録しています。
・ 「ENKI®」は当社の登録商標です。

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