生体関連アーカイブ - TechnoSuruga Laboratory Co.,Ltd.

腸内環境分析用糞便採取キット・採取容器

tslseeqadmin — Mon, 22 Sep 2025 00:35:40 +0000

腸内環境分析用糞便採取キット・採取容器

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特長


糞便中の菌叢を室温 (1℃～30℃) で1ヶ月程度、安定的に維持できる保存液

豊富なバリエーションで目的に応じた使い分けが可能

糞便採取容器（保存液あり）を含む製品は、コロナウイルスの不活化を確認済み

概要

腸内細菌叢を解析する場合、採取した糞便の菌叢を安定的に維持する必要があります。当社では被験者様がご自宅で採便しても、手順通りの採便で必要な便量を確保でき、室温のまま回収可能な採取容器を販売しております。
ブラシ型の採取容器は便潜血用を利用しており、固形便の採取に適し、アンプリコンシーケンス解析に適切な便量を確保できます。
また、メタボロキーパー®で採取した糞便は、凍結させることなく糞便中有機酸 (短鎖脂肪酸) 分析を行えます。腸内細菌叢解析にも利用可能です。

SDS

取扱説明書

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メタボロキーパー SDS

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採便容器ブラシ型 SDS

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メタボロキーパー取扱説明書

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採便容器ブラシ型取扱説明書



楽流カップ
取扱説明書

製品内容

１，糞便採取キット

１キットごとにチャック付きの袋に個包装していますので、被験者に直接配布できます。
また糞便採取シートに代わり楽流カップをキット内容とした製品もご用意しております。

内容物 (1 キット )	数量
糞便採取容器（保存液 : あり、形状 : ブラシ型）	1 本
糞便採取シート	1 枚
取扱説明書	1 式

糞便採取キット（型番「FS-0017」）
保存液:あり、形状:ブラシ型
糞便採取シート

〈注意点〉
・ブラシ型容器に対する注意点：容器が破損する恐れがありますので、ブラシ型容器は冷凍保存しないで下さい。

２，糞便採取容器

糞便採取容器のみの販売となります。
形状はブラシ型です。
個包装での納品ではありません。ご依頼いただいた本数をまとめて梱包して納品します。

保存液:あり、形状:ブラシ型（型番「FS-0016」）

〈注意点〉
・ブラシ型容器に対する注意点：容器が破損する恐れがありますので、ブラシ型容器は冷凍保存しないで下さい。

３，「メタボロキーパー® 」糞便採取キット

糞便中有機酸（短鎖脂肪酸）と腸内細菌叢を室温 (1℃～30℃)で1ヶ月保持できる採便キット。

凍結させることなく、糞便中有機酸（短鎖脂肪酸）分析および腸内細菌叢解析が行えます。
容器上部に保存液が充填されており、保存液中の内部標準物質により、定量的に濃度補正が可能となっています。
楽流カップWIDEと組み合わせたキット販売となります。

内容物 (1 キット )
メタボロキーパー®	1 本
楽流カップ WIDE	1 枚
取扱説明書	1 式

（型番「FS-0015」）

〈採取方法〉

〈製品動画〉

〈注意点〉
製品の性質上、急激な温度変化や外部からの衝撃により液漏れを起こすことがございます。液漏れを確認した場合は、開封せず当社までご連絡下さい。交換にて対応いたします。

製品内容 (オプション)

１，楽流カップ　WIDE

便座または便器に貼り付けて設置できますので、排便後も便器にセットした状態を保持できます。
そのため、便が水没したり自動洗浄で流れたりする心配がなく、慌てずに採便することが可能です。
使用後はそのまま水に流せますので、便器内に手を入れる必要がありません。

便器に貼って使用

便座に貼って使用

（型番「FS-0005」）

２，糞便採取シート

便器の内側の水面に浮かべて使用します。シート上に排便することで、便器内の水中への沈み込みを防ぎ、採便後はそのまま水に流すことができます。ただし、便が水没したり自動洗浄で流れる可能性があるため、すばやく採便する必要があります。

（型番「FS-0004」）

３，目隠しシール

糞便採取容器 (形状: スプーン型) 専用の目隠しシールです。
容器に貼っていただくことで、内容物を遮蔽します。全てを覆うサイズではないため、シールの隙間から採取されているかどうかが確認できます。
シールはフリーザー (-30℃) での使用も可能な材質で、必要な情報を自由に書き込むことができます。

（型番「FS-0010」）

４，保管箱

糞便採取容器専用の紙製の保管箱です。
それぞれ容器を立てて収納することができます。実際の保管箱には上蓋を付属して納品します。
保管箱はフリーザー (-30℃) での使用も可能な材質で、必要な情報を自由に書き込むことができます。
なお、容器が破損する恐れがありますので、ブラシ型容器は冷凍保存しないで下さい。

【左】　ブラシ型保管箱（100本立て）（型番「FS-0011B」）　　　　　外寸法：L147 ㎜×W147 ㎜×H125 ㎜
【中央】メタボロキーパー®保管箱（16本立て）（型番「FS-0011M」）　外寸法：L147 ㎜×W147 ㎜×H125 ㎜
【右】　スプーン型保管箱（25本立て）（型番「FS-0011S」）　　　　　外寸法：L147 ㎜×W147 ㎜×H97 ㎜

試験項目と使用可能な糞便採取容器

試験項目に応じた種類を以下からご選択下さい。

試験項目	糞便採取容器のタイプ	Cat.No.
アンプリコンシーケンス解析	保存液 : あり、形状 : ブラシ型	FS-0016	FS-0017
アンプリコンシーケンス解析＋糞便理化学分析	メタボロキーパー® 有機酸 ( 短鎖脂肪酸) 分析に限ります※¹	FS-0015
T-RFLP フローラ解析（MN-1 法）	保存液 : あり、形状 : ブラシ型	FS-0016	FS-0017
T-RFLP フローラ解析（MN-2 法）	保存液 : あり、形状 : ブラシ型	FS-0016	FS-0017
T-RFLP フローラ解析 (MN-2 法 ) ＋糞便理化学分析	メタボロキーパー® 有機酸 ( 短鎖脂肪酸) 分析に限ります※¹	FS-0015
リアルタイム PCR 解析＋糞便理化学分析	メタボロキーパー® 有機酸 ( 短鎖脂肪酸) 分析に限りま※¹※²	FS-0015
糞便理化学分析	メタボロキーパー® 有機酸 ( 短鎖脂肪酸) 分析に限ります※¹	FS-0015

※1　メタボロキーパー®を使用して実施可能となる糞便理化学分析は、糞便中有機酸 ( 短鎖脂肪酸) 分析となります。
※2　リアルタイムPCR解析をご依頼される場合には、同時に糞便中有機酸 ( 短鎖脂肪酸) 分析のご依頼が必要となります。

採便前後の糞便採取容器の保存と期限

糞便採取容器のタイプ	保存対象	採便後の保存温度帯	採便後の輸送	採便前の使用期限
保存液：あり、形状：ブラシ型容器が破損する恐れがあるため冷凍保存しないで下さい。	菌叢	室温保存 (冷蔵推奨) 室温で約1 ヶ月保存可能	冷蔵( 常温輸送可 )	6 ヶ月( 室温 /冷蔵 )

メタボロキーパー®※	菌叢、有機酸 ( 短鎖脂肪酸)

※ 可能な限り温度変化の少ない環境（冷蔵推奨）で、立てた状態で保管下さい。
※ 長期保管の場合、気密性の高い容器に移し、冷蔵保管することを推奨します。

採便後の糞便採取容器の保管条件

（容器自体の破損、変性を防ぐ温度帯）

糞便採取容器のタイプ	保管温度
保存液：あり、形状：ブラシ型容器が破損する恐れがあるため冷凍保存しないで下さい。	1℃以上、 30℃以下で保管
メタボロキーパー®	-30℃以上、 30℃以下で保管

価格・納期

製品名	Cat. No.	仕様	入数	価格（税抜）	納期
腸内フローラ解析用糞便採取キット	FS-0017	〈個包装〉・保存液あり・ブラシ型・採便シート・説明書	10 キット	10,000 円	5 営業日 (北海道、青森県、秋田県、沖縄県、九州などは 6 営業日 )
			30 キット	28,500 円
			50 キット	45,000 円
			100 キット	88,000 円
「メタボロキーパー®」糞便採取キット	FS-0015	〈個包装〉・「メタボロキーパー®」・楽流カップ WIDE ・説明書	10 キット	32,000 円	10 営業日 (北海道、青森県、秋田県、沖縄県、九州などは 11 営業日 )
糞便採取容器のみ	FS-0016	・保存液あり・ブラシ型	10 本	7,500 円	5 営業日 (北海道、青森県、秋田県、沖縄県、九州などは 6 営業日 )
			30 本	21,000 円
			50 本	32,500 円
			100 本	63,000 円

製品名	Cat. No.	仕様	入数	価格（税抜）	納期
採便シート	FS-0004	-	10 枚	700 円	5 営業日 ( 北海道、青森県、秋田県、沖縄県、九州などは 6 営業日 )
楽流カップ WIDE	FS-0005	-	10 枚	1,600 円
目隠しシール	FS-0010	-	10 枚	600 円
個装用ビニール袋	FS-0019	-	100 枚	1,800 円
保管箱	FS-0011B	ブラシ型用	1 箱	2,400 円
	FS-0011S	スプーン型用		2,100 円
	FS-0011M	メタボロキーパー®用		2,100 円

採便量の目安

形状 : ブラシ型保存液：あり	メタボロキーパー®
ー	1.5g
ブラシ全体	スプーンすり切り一杯
糞便複数箇所を突き刺して採取	キット付属のすり切り棒でスプーンすり切り一杯

ご使用上の注意

各製品の取扱い説明書に従いご使用下さい。
製品の性質上、急激な温度変化や外部からの衝撃により液漏れを起こすことがあります。
糞便を採取した後は、液漏れしないように本製品の蓋を確実に締めて下さい。また、一度締めた蓋を再度開閉しないで下さい。
本製品の再販および本製品を改変し再販することに起因する損失・損害等については、当社では一切の責任を負いません。
リアルタイムPCR解析や糞便理化学分析を実施される場合には、保存液なしの容器をご使用下さい。
「取扱説明書」および「SDS」が必要な場合、当社ホームページよりダウンロードしてご利用下さい。
保存液が誤って皮膚に付いたり目や口に入った場合は、水で充分に洗い流し、直ちに医師に連絡して下さい。
乳幼児やペットの手の届かない場所に保管し、誤飲されないようにご注意下さい。
容器のふちに便が付着しないようご注意下さい。気密性が損なわれ、漏洩の原因となることがあります。

ご依頼前の同意事項

・個包装用ビニール袋、保管箱を除き、10 キット(本・枚) 単位でご注文下さい。
・計100キット (本) 以上のご依頼の場合の納期についてはお問い合わせ下さい。
・本製品は、研究用試薬 (キット) であり医療品や医療器具ではありません。ヒトへの医療、臨床診断にはご使用いただけません。
・本製品を用いた検査結果判定により発生する問題に関して、当社は一切の責任を負いません。
・本製品は、DNAの保存性に関する製品であり、RNAの保存性はありません。
・ご依頼前の同意事項 (共通) を必ずご確認下さい。
・製品到着次第、製品の破損、不足、不良等をご確認下さい。破損、内容物漏れ等の不良を確認した場合は、開封せず当社までご連絡下さい。製品納品後、2週間以内のお申し出に限り交換にて対応します。
・保存液が含まれる製品は、製造過程により、濃度、容量に若干の差異が生じることがあります。
・メタボロキーパー®（特許第7125579号）を利用した糞便理化学分析は、当社でのみ分析できるように設計しています。お客様での分析実施を保証するものではありません。

分析ごとの同意事項、ご依頼前の同意事項（共通）およびテクノスルガ・ラボ基本約款を確認しました。

ファイルをダウンロードする
302_sampling_kit_V23.docx

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生体アンプリコンシーケンス解析

tslseeqadmin — Tue, 24 Sep 2024 05:42:29 +0000

生体アンプリコンシーケンス解析

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当社では、2025年8月1日よりアンプリコンシーケンス解析に使用するシーケンサーを、MiSeq®（Illumina社）からMiSeq® i100シリーズ（Illumina社）へ切り替えました。
MiSeq i100シリーズは、従来のMiSeqに比べて、より低コストかつ短納期での解析が可能です。
なお、従来のMiSeqでの解析については、メーカーからの当該機器の販売終了などを考慮し、2026年7月末日頃まで継続の予定です。ご希望の方は［従来機「MiSeq」をご利用希望の方］をご覧ください。

※MiSeq®はIllumina社の登録商標です。

特長


様々な動物種の糞便、ヒトの口腔内や皮膚検体といった幅広い生体由来検体に対応

検体のDNA抽出からデータ解析までの一括対応、抽出済DNAでの受入、fastqデータ納品 (解析なし) など、多様なニーズに対応 (1検体から申込み可能)

糞便は細菌とアーキア (古細菌) を一括で解析できるプライマーを推奨 (メタン産生アーキアなどの検出が可能）

アクネ菌 (Cutibacterium acnes) の検出効率を高めた皮膚菌叢解析用プライマーを選択可能

 データ解析ソフトウェアは2種類から選択可能

【細菌・アーキアの場合】
セット1：Metagenome@KIN (データベース『RDP』あるいは『テクノスルガ・ラボ微生物同定データベース』)
セット2：QIIME2 (データベース『Greengenes』あるいは『SILVA』)

【カビ・酵母の場合】
セット1：Metagenome@KIN (データベース『RDP』)
セット2：QIIME2 (データベース『UNITE』)


DNA抽出からデータ解析まで全て当社内で作業

概要

アンプリコンシーケンス解析は、多様な生物種が混在する検体中の生物群集を解析する優れた方法のひとつです。
検体から直接抽出した混合DNAについて、検体を識別するためのバーコード配列を付加したプライマーによりPCR増幅～シーケンス解析を行い、一度に数万～数十万の配列を得ます。
検体ごとに異なるバーコード配列が付加されているため、数十種類の異なる検体由来の混合DNAを一度に解析しても、バーコード配列をもとに得られた塩基配列がどの検体に由来するかを判別することができます。一度の解析で大量の塩基配列を得ることができ、また、マイナーな細菌を含め網羅的に細菌（カビ・酵母）を検出することができます。多検体、多数の塩基配列解析を行う場合のコストパフォーマンスにも優れます。

受入可能な検体

検体区分 ( 種類)	由来	検体の種類※	対象
A 区分：糞便検体	ヒト	糞便	細菌・アーキア、カビ・酵母のDNA
	マウス、ラットなどの実験動物類	糞便、腸管内容物
	ブタ、ウシ、ウマなどの家畜類	糞便、腸管内容物、ルーメン液
	ニワトリなどの家禽類	糞便、腸管内容物
	イヌ、ネコなどのペット類	糞便
	魚類、昆虫、その他	糞便、腸管内容物
B 区分：その他生体由来検体	ヒト（その他動物種はご相談下さい）	唾液、プラーク
		皮膚拭取物
		膣内拭取物
DNA抽出物	ー	PCR 増幅が確認されたDNA抽出物 PCR 増幅が確認できたことを示す電気泳動像を必ずご提供下さい。

※ 血液、臓器、細胞組織およびそれらが付着した検体の受け入れはできません。
※ 哺乳類・鳥類などの野生動物 (野良も含む) 由来の検体は、送付前にお客様の元で加熱処理（85℃ 15分以上）をお願いします。

必要検体量・送付方法

検体の種類			必要量	留意点および送付方法
A区分	糞便、腸管内容物、ルーメン液	気密性の高い容器	0.2 ～ 0.5 g	採取後速やかに冷凍保存、冷凍輸送
		糞便採取容器（保存液あり）あるいはメタボロキーパー®※		採取後速やかに冷蔵保存冷蔵輸送推奨、常温輸送可
B区分	A 区分以外口腔内容物（唾液、プラーク）、皮膚拭取物など	スワブ 1.5 mL チューブなど	0.2 ～ 1 mL ( 唾液 )	唾液、舌苔、口腔粘膜、プラークを採取し、速やかに冷凍保存、冷凍輸送
				綿棒やコットンなどで広範囲を拭き取った検体は、極少量の適切な溶液（PBS、生理食塩水、滅菌水など）に移し、速やかに冷蔵保存、冷蔵輸送
		メタフロキーパー（皮膚、唾液）		採取後速やかに冷蔵保存冷蔵輸送推奨、常温輸送可
DNA抽出物			濃度　5 ng/µL 総量　30 µL 以上（1 領域を追加ごとに＋15 µL 以上）	抽出後速やかに冷蔵保存、冷蔵輸送

※保存液は捨てずに検体を採取し、採取後も採取容器は冷凍せず、保存液の中に検体が入った状態でご送付下さい。

生体由来検体の返送

ガイド「生体由来検体の返送に関するご案内」をご確認下さい。

解析の流れ


DNA抽出/精製

PCR増幅

PCR産物の定量

シーケンス配列決定

プライマー配列の除去
 データ解析^※

※データ解析の工程はセット1、セット2で異なります。

仕様

対象微生物		細菌・アーキア		カビ・酵母
解析対象		DNA
対象微生物と遺伝子領域*¹		細菌	16S rDNA V1 ～ V2 領域	ITS2 領域
		細菌	16S rDNA V3 ～ V4 領域
		細菌・アーキア	16S rDNA V3 ～ V4 領域
		アーキア	16S rDNA V3 ～ V4 領域
		細菌 (皮膚菌叢解析用)	16S rDNA V3 ～ V4 領域*²
リード数*³		3万リード以上 / 検体
解析機種		MiSeq i100シリーズ(Illumina)
データ解析*⁴	セット1 ：Metagenome@KIN	RDP*⁵ およびテクノスルガ・ラボ「微生物同定データベース」		RDP*⁵
	セット2 ：QIIME2⁶ ⁷	Greengenes database⁵あるいはSILVA database⁵		UNITE*⁵

*1　解析領域の違いによる結果の違いについては、当社では考察しません。
*2　標準仕様のV3 ～ V4領域のプライマー配列の一部を改変し、アクネ菌(Cutibacterium acnes)の検出効率を上げています。
*3　3万リード取得を目安に解析を実施しますが、獲得できる配列数は検体の性状により変動します。
*4　データ解析は、セット1またはセット2のどちらかをご選択下さい。
*5　RDP (Ribosomal Database Project)、Greengenes database、SILVA databaseおよびUNITEは公共の解析データベースです。
*6　セット2 (QIIME2) は一次解析までの報告です。二次解析 (多様性解析、統計解析) は、別途追加解析のご指示を下さい。
*7　GreengenesまたはSILVAのどちらかご選択下さい。データベースの違いによる結果の違いについては、当社では考察しません。

納品内容

報告内容	形式
次世代シーケンサー ( NGS ) によるシーケンス生データ	fastq ファイル
次世代シーケンサー ( NGS ) によるシーケンスデータ( クオリティーフィルタリング、キメラチェック後 )	fasta ファイル
データ解析結果※	csv ファイル、 html ファイル

※ 詳細は「アンプリコンシーケンスデータ解析 (Metagenome@KIN)」をご参照下さい。
※ ご依頼内容や検体数によって納品されないファイルがあります。

■ 報告サンプル (セット1：Metagenome@KIN)

ドーナツグラフ		検体の菌叢を構成する帰属分類群を界（内側）～属または種（外側）へ一つの図として表示します。htmlファイルなので、グラフにカーソルを合わせ、クリックすることで分類群の名前や分類階級をハイライトすることもできます。群集構造全体の理解を視覚的にサポートします。
解析例
検体間比較グラフ		全検体の、ある分類階級における帰属分類群の内訳を並べて表示します。検体間の群集構造の違いを俯瞰する際に便利です。
クラスター解析		デンドログラムおよび、ヒートマップ画像が分類階級ごとに作成されます。
主成分分析		主成分の二次元プロット画像が分類階級ごとに作成されます。検体間の相違を散布図で示します。

検体間比較グラフ、クラスター解析、主成分分析は、論文投稿を前提とした解像度ではありません。論文投稿を目的とする場合には、別途「アンプリコンシーケンスデータ解析 (QIIME2)」または「統計分析ソフトRによるデータ解析」をご利用下さい。

報告内容		形式
次世代シーケンサー ( NGS ) によるシーケンス生データ		fastq ファイル
QIIME2 出力データファイルデータ解析 ( 一次解析 ) 結果※	代表配列とリード数の一覧	qzv ファイル
	相同性検索結果 ( 表、バーチャート )

※ 多様性解析や統計解析（二次解析）は含みません。詳細は「アンプリコンシーケンスデータ解析 (QIIME2)」をご参照下さい。
※ ご依頼内容や検体数によって納品されないファイルがあります。

■ 報告サンプル (セット2：QIIME2)

価格・納期

区分	試験項目	依頼形態	単価（税抜）*¹	目安納期（DNA解析）² ³
A区分	アンプリコンシーケンス解析（細菌・アーキア）細菌 V1～V2 細菌 V3～V4 細菌／アーキア V3～V4 アーキア V3～ V4 アンプリコンシーケンス解析（カビ・酵母） ITS2	検体にてご依頼の場合	15,000円／検体	20 営業日～
		DNA抽出物にてご依頼の場合	12,000円／検体	18 営業日～
		fastqファイル納品の場合	14,500円／検体	20 営業日～
		DNA抽出物にてご依頼、fastqファイル納品の場合	11,500円／検体	18 営業日～
B区分	アンプリコンシーケンス解析（細菌・アーキア）細菌 V1～V2 細菌 V3～V4 細菌／アーキア V3～V4 アーキア V3～ V4 皮膚菌叢解析用アンプリコンシーケンス解析（カビ・酵母） ITS2	検体にてご依頼の場合	19,000円／検体	24 営業日～
		DNA抽出物にてご依頼の場合	12,000円／検体	18 営業日～
		fastqファイル納品の場合	18,500円／検体	24 営業日～
		DNA抽出物にてご依頼、fastqファイル納品の場合	11,500円／検体	18 営業日～

セット2をご選択いただいた場合、多様性解析や統計解析(二次解析)が可能です。費用は一式＋30,000円 (税抜) 納期は＋5営業日となります。

*1 　2つ以上の領域を同時に解析する場合には、1領域追加ごとにDNA抽出の重複費用として1検体当たりA区分 3,500円 (税抜) 、B区分7,000円 (税抜)を減額します。
*2　 2つ以上の領域を同時に解析する場合には、1領域追加ごとに納期は＋5営業日の追加になります。
*3　 PCR増幅が確認されないなど検体の性質に帰因する不具合により作業のやり直しが発生する場合は納期を延長させていただく場合があります。

従来機「MiSeq」をご利用希望の方

従来機MiSeqでの解析をご希望のお客様は、本ページ下部の「従来機MiSeqでの解析」用依頼書をダウンロードして、必要事項をご記入のうえ、ご依頼ください。

なお、今回の切り替えにあたり、MiSeqとMiSeq i100シリーズの比較解析を当社にて実施いたしました。
結果を以下よりご確認いただけますので、ご検討の際の参考資料としてぜひご覧ください。
▶　MiSeq®とMiSeq® i100シリーズの比較解析結果（当社実施）

※異なるシーケンサープラットフォームの利用による結果の違いについては、当社では考察しません。あらかじめご了承ください。

■価格・納期

区分	試験項目	単価（税抜）*¹	目安納期（DNA解析）*²
A区分	アンプリコンシーケンス解析（細菌・アーキア）細菌 V1～V2 細菌 V3～V4 細菌／アーキア V3～V4 アーキア V3～ V4 アンプリコンシーケンス解析（カビ・酵母） ITS2	24,000円／検体	40営業日～
B区分	アンプリコンシーケンス解析（細菌・アーキア）細菌 V1～V2 細菌 V3～V4 細菌／アーキア V3～V4 アーキア V3～ V4 皮膚菌叢解析用アンプリコンシーケンス解析（カビ・酵母） ITS2	32,000円／検体	40営業日～

セット2をご選択いただいた場合、多様性解析や統計解析(二次解析)が可能です。費用は一式＋30,000円 (税抜) 納期は＋5営業日となります。

*1 　2つ以上の領域を同時に解析する場合には、1領域追加ごとにDNA抽出の重複費用として1検体当たり3,000円 (税抜)を減額します。
*2　 2つ以上の領域を同時に解析する場合には、1領域追加ごとに納期は＋5営業日の追加になります。

■仕様

対象微生物		細菌・アーキア	カビ・酵母
解析対象		DNA
遺伝子領域*¹		16S rDNA V1 ～ V2 領域（細菌） 16S rDNA V3 ～ V4 領域（細菌） 16S rDNA V3 ～ V4 領域（細菌／アーキア） 16S rDNA V3 ～ V4 領域（アーキア） 16S rDNA V3 ～ V4 領域（皮膚菌叢解析用）*²（細菌）	ITS2 領域
リード数*³		1 万リード以上 / 検体
解析機種		従来機MiSeq
データ解析*⁴	セット1 ：Metagenome@KIN	RDP *⁵ およびテクノスルガ・ラボ「微生物同定データベース」	RDP *⁵
	セット2 ：QIIME2 ⁶ ⁷	Greengenes database ⁵またはSILVA database ⁵	UNITE*⁵

*1　解析領域の違いによる結果の違いについては、当社では考察しません。
*2　標準仕様のV3 ～ V4領域のプライマー配列の一部を改変し、アクネ菌(Cutibacterium acnes)の検出効率を上げています。
*3　クオリティーフィルタリング、キメラチェック後のリード数です。
*4　データ解析は、セット1またはセット2のどちらかをご選択下さい。
*5　RDP (Ribosomal Database Project)、Greengenes database、SILVA databaseおよびUNITEは公共の解析データベースです。
*6　セット2 (QIIME2) は一次解析までの報告です。二次解析 (多様性解析、統計解析) は、別途追加解析のご指示を下さい。
*7　GreengenesまたはSILVAのどちらかご選択下さい。データベースの違いによる結果の違いについては、当社では考察しません。

ご依頼前の同意事項

・メディア（DVD-R）による配送納品のみとなります。
・ご依頼前の同意事項（共通）を必ずご確認下さい。
・お預かりした検体を返送する場合、当社は試験前の検体と同等の状態を保証するものではありません。
・ご依頼前の解析手法などの選択についてのアドバイスには可能な範囲で対応しますが、最終的な選択はお客様の責任にてご判断下さい。

▼ MiSeq i100シリーズでの解析（推奨）

生体Ａ区分のご依頼書はこちらから

分析ごとの同意事項、ご依頼前の同意事項（共通）およびテクノスルガ・ラボ基本約款を確認しました。

ファイルをダウンロードする
211A-2_NGS_living_TypeA_i100_V2.zip

生体Ｂ区分のご依頼書はこちらから

分析ごとの同意事項、ご依頼前の同意事項（共通）およびテクノスルガ・ラボ基本約款を確認しました。

ファイルをダウンロードする
211B-2_NGS_living_TypeB_i100_V2.zip

▼ 従来機MiSeqでの解析

生体Ａ区分のご依頼書はこちらから

分析ごとの同意事項、ご依頼前の同意事項（共通）およびテクノスルガ・ラボ基本約款を確認しました。

ファイルをダウンロードする
211A_NGS_living_TypeA_V20.zip

生体Ｂ区分のご依頼書はこちらから

分析ごとの同意事項、ご依頼前の同意事項（共通）およびテクノスルガ・ラボ基本約款を確認しました。

ファイルをダウンロードする
211B_NGS_living_TypeB_V20.zip

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皮膚菌叢解析用採取キット　メタフロキーパー (皮膚)

tslseeqadmin — Fri, 20 Sep 2024 00:11:02 +0000

皮膚菌叢解析用採取キット　メタフロキーパー (皮膚)

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生体関連

特長


保存液により室温（1～30℃）での保管が可能

スワブタイプで取り扱いが容易

保存液によるコロナウイルス不活化を確認済み

概要

容易に皮膚常在菌の採取、保存を可能とした皮膚菌叢解析用採取キットです。室温でも菌叢を維持することができます。
本キットでは、生理食塩水に浸されたスワブの拭き取り面を変えながら皮膚を擦ることで皮膚常在菌を採取し、拭き取ったスワブを保存液に浸すことで、菌叢の変化を抑えます。
粘着テープによる採取とは異なり、角質へのダメージも少ない採取方法です。

SDS

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メタフロキーパー® (皮膚) SDS

取扱説明書

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メタフロキーパー® (皮膚) 取扱説明書

製品内容

内容物 (1 キット )
メタフロキーパー ®（皮膚）	生理食塩水（透明）入り 1 本生理食塩水（透明）入り容器は拭取用のスワブ付きです。
	保存液（青色）入り 1 本
取扱説明書	1 枚

価格・納期

製品名	Cat. No.	入数	価格 ( 税抜 )	納期
皮膚菌叢解析用採取キット　メタフロキーパー® ( 皮膚 )	SS-0001	10 キット	11,000 円	15 営業日 ( 北海道、青森県、秋田県、沖縄県、九州などは 16 営業日 )

採取前後の採取容器の保存と期限（菌叢を維持できる目安期間）

採取前	採取後	採取後の輸送
6ヶ月( 室温/ 冷蔵)	室温約1 ヶ月 ( 冷蔵推奨)	冷蔵 (常温輸送可 )
容器が破損する恐れがあるため冷凍保存しないで下さい。		冷蔵 (常温輸送可 )

ご使用上の注意

採取キットの取扱い説明書に従いご利用下さい。
保存液（青色）が誤って皮膚に付いたり目や口に入った場合は、水で充分に洗い流し、直ちに医師に連絡して下さい。
乳幼児やペットの手の届かない場所に保管し、誤飲されないようにご注意下さい。

動画【メタフロキーパーの使用方法】

ご依頼前の同意事項

・ 10キット単位でご注文下さい。
・本製品は、研究用試薬 (キット) であり医療品や医療器具ではありません。ヒトへの医療、臨床診断にはご使用いただけません。
・本製品は、RNAの保存性はありません。
・洗顔後や狭い範囲、あるいは弱い力による拭き取りでは、解析に必要な微生物量を確保できない場合があります。
・本製品は定量的な分析にはご使用できません。
・本製品を用いた検査結果判定により発生する問題に関して、当社は一切の責任を負いません。
・本製品の再販および本製品を改変し再販することに起因する損失・損害等については、当社では一切の責任を負いません。
・ご依頼前の同意事項 (共通) を必ずご確認下さい。
・製品到着次第、製品の破損、不足、不良等をご確認下さい。破損、保存液漏れ等の不良を確認した場合は、開封せず当社までご連絡下さい。製品納品後、2週間以内のお申し出に限り交換にて対応します。
・保存液が含まれる製品は、製造過程により、濃度、容量に若干の差異が生じることがあります。

分析ごとの同意事項、ご依頼前の同意事項（共通）およびテクノスルガ・ラボ基本約款を確認しました。

ファイルをダウンロードする
302_sampling_kit_V22.docx

投稿皮膚菌叢解析用採取キット　メタフロキーパー (皮膚) は TechnoSuruga Laboratory Co.,Ltd. に最初に表示されました。

糞便理化学分析

tslseeqadmin — Thu, 19 Sep 2024 08:13:12 +0000

糞便理化学分析

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生体関連

特長


ヒト糞便の他に、マウス・ラット糞便、消化管内容物などの分析が可能

腸内代謝物分析、さらにIgA産生や胆汁酸分泌などの宿主側の応答の評価に

概要

糞便理化学分析の各対象成分は、「必要検体量・分析対象成分/評価項目」に記載の評価項目を測定、分析します。

糞便中有機酸 (短鎖脂肪酸)分析

腸内において有機酸 (短鎖脂肪酸)は、腸管内を酸性に保ち、腸の蠕動運動や腸管からの水の分泌を促進するほか、感染防御、腐敗産物の生産抑制、便性・便通の改善効果を持つことが知られています。有機酸は、腸内細菌による食物繊維や炭水化物の代謝物であり、タンパク質やペプチドの消化でも増加することが知られ、腸内細菌叢と共に評価することが望まれます。酢酸、プロピオン酸、酪酸などの短鎖脂肪酸は、宿主の短鎖脂肪酸の受容体 (GPR41、GPR43など) を介して肥満や糖尿病に関連することが近年報告されています。例えば、GPR41は主にプロピオン酸と酪酸により活性化され、交感神経系を介して、エネルギー恒常性の維持に関わることが報告されています。また、GPR43は酢酸とプロピオン酸によって活性化され、エネルギーの白色脂肪組織への取り込みを抑制し、脂肪の蓄積を抑えていると報告されています。

▶　糞便中有機酸（短鎖脂肪酸）分析と腸内細菌叢解析の両方をご検討中の方は、こちらをご覧ください。

糞便中胆汁酸分析

胆汁酸は、コレステロールの代謝物であり、脂溶性成分の消化吸収、界面活性による腸内細菌叢の変化に関与しています。
腸内細菌叢の変化は、宿主のコレステロール・胆汁酸代謝に影響を及ぼします。ヒトの一次胆汁酸であるコール酸とケノデオキシコール酸は、小腸内で腸内細菌により代謝を受け、それぞれデオキシコール酸とリトコール酸に代謝されます。ラットやマウスは一次胆汁酸としてムリコール酸を生成します。二次胆汁酸は、大腸がん発症のプロモーターと言われています。

糞便中腐敗産物分析

腐敗産物は、糞便の悪臭の原因と言われ、腸内環境の悪化を示す指標として知られています。腸内細菌によりチロシンからフェノール類が作られ、トリプトファンからインドールやスカトールが作られます。産出されたフェノール類の多くは血液を介して表皮形成過程に悪影響を及ぼすことから、肌荒れを起こす要因の一つに挙げられています。

糞便中アンモニア分析

肝不全、肝硬変、尿毒症などの肝臓に関わる疾患は、アンモニアを尿素に合成する肝臓の解毒機能を低下させるため、血液中にアンモニアが増加することが知られています。
食餌品に含まれるタンパク質や消化管への分泌液に含まれる尿素は、腸内細菌によって分解されてアンモニアに代謝されます。腸内環境を改善することで糞便中のアンモニア量を低減できたとの報告も多くあります。

糞便pH測定

糞便のpHが、低いほど色は黄色っぽく、pH7.0 (中性) を越えると茶色っぽく、pH8.0 (弱アルカリ性) になると黒っぽくなります。乳幼児の糞便はpHが4.5～5.5 (弱酸性) で黄色、健康な大人の糞便はpHが5.5～6.0で黄土色です。
大腸菌 ( Escherichia coli )、ウェルシュ菌 ( Clostridium perfringens ) などの悪玉菌は、アルカリ性の腸内環境を好んで発育し、pH6.0以下 (弱酸性) になると発育しにくくなります。

糞便水分測定

糞便は、腸内貯留時間が長いと水分が腸管に吸収されて硬くなり、反対に腸内貯留時間が短いと水分が腸管に吸収されず、柔らかくなります。水分が70％未満では排便時に苦痛を感じるようになり、80％以上になると軟便となり、90％を超えると水様便となります。水分は、pHと負の相関があります。

糞便中IgA分析（ヒト）

腸管には全末梢リンパ球の約70％に相当する免疫系細胞が存在しており、腸内細菌が宿主の消化管に定着することによって、免疫系が刺激・活性化されていると考えられています。小腸粘膜面での微生物に対する特徴的な応答に免疫グロブリンの一種であるIgA産生があり、これはプロバイオティクス乳酸菌の摂取により亢進し、感染防御へとつながることが期待されています。なお、糞便中IgA分析は、単量体と二量体を測定しています。

受入可能な検体

検体区分	由来	検体の種類
A区分	ヒト	糞便
	マウス、ラットなどの実験動物類	糞便、腸管内容物
	ブタ、ウシ、ウマなどの家畜類
	ニワトリなどの家禽類
	イヌ、ネコなどのペット	糞便
	その他	お問い合わせ下さい

※　血液、臓器、細胞組織およびそれらが付着した検体の受け入れはできません。

必要検体量・対象成分/評価項目

試験項目	対象成分/ 評価項目	定量下限値	分析機器、または測定・分析方法	分析必要量※ ヒト・マウス･ラット
糞便中有機酸 (短鎖脂肪酸)分析	・酢酸・プロピオン酸・コハク酸・乳酸	0.05 mg/g	LC (pH 緩衝化ポストカラム電気伝導度検出法)	ヒトの場合200 mg マウス、ラットの場合60 mg
糞便中有機酸 (短鎖脂肪酸)分析	・iso- 酪酸・iso- 吉草酸・n- 酪酸・n- 吉草酸・ギ酸	0.1 mg/g	LC (pH 緩衝化ポストカラム電気伝導度検出法)
糞便中胆汁酸分析	＜非抱合型胆汁酸： 14 成分＞・コール酸・α , β , ωムリコール酸・ヒオコール酸・ケノデオキシコール酸・デオキシコール酸・ウルソデオキシコール酸・ヒオデオキシコール酸・リトコール酸・デヒドロコール酸・イソデオキシコール酸・7- ケトデオキシコール酸・7- ケトリトコール酸	-	外部委託先によります
糞便中胆汁酸分析		-	外部委託先によります
糞便中腐敗産物分析	・フェノール類（p- クレゾール、フェノール、 4- エチルフェノール）・インドール・スカトール	0.3 μg/g	GC-MS
糞便中アンモニア分析	・アンモニウムイオン ( アンモニア濃度に換算)	0.5 μg/g	イオンクロマトグラフィー
糞便pH測定	・pH	-	pH 計 ( ガラス電極法)
糞便水分測定	・水分	-	乾燥法	0.5 ～ 1 g
糞便中IgA 分析	・IgA ( 単量体、二量体 )	1 μg/g	ELISA 法	ヒトのみ 200 mg

※ 食物残渣が多い場合には分析必要量に満たないことや、計量時のロスもありますので、分析必要量以上の送付をお願いします。
※ 分析必要量は1項目当たりの量になります。複数項目を同時にご依頼の場合には、お問い合わせ下さい。

送付方法

検体の種類		留意点および送付方法	試験項目
糞便、腸管内容物	気密性の高い容器	採取後速やかに冷凍保存、冷凍輸送	全項目
糞便、腸管内容物	メタボロキーパー®※	採取後速やかに冷蔵保存冷蔵輸送推奨、常温輸送可	糞便中有機酸 (短鎖脂肪酸)分析

※ 可能な限り温度変化の少ない環境（冷蔵推奨）で、立てた状態で保管下さい。
・保存液は捨てずに検体を採取し、採取後も採取容器は冷凍せず、保存液の中に検体が入った状態でご送付下さい。
・採取容器にビニール袋やチャック袋を使用することはご遠慮下さい。

生体由来検体の返送

ガイド「生体由来検体の返送に関するご案内」をご確認下さい。

納品内容

報告内容	形式
各試験項目に対応する対象成分の濃度または測定値	Excel ファイル

価格・納期

試験項目	検体数	単位	単価（税抜）	納期
糞便中有機酸 (短鎖脂肪酸)分析	1 ～ 3	検体	30,000 円	17 営業日～
	4 ～ 6		19,000 円
	7 ～ 29		14,000 円
	30 ～		8,000 円	お問い合わせ下さい
糞便中胆汁酸 ( 非抱合型 ) 分析※¹	1 ～ 3	検体	お問い合わせ下さい	お問い合わせ下さい
	4 ～ 6
	7 ～ 29
	30 ～
糞便中腐敗産物分析	1 ～ 3	検体	37,000 円	17 営業日～
	4 ～ 6		24,000 円
	7 ～ 29		19,000 円
	30 ～		13,000 円	お問い合わせ下さい
糞便中アンモニア分析	1 ～ 3	検体	19,000 円	17 営業日～
	4 ～ 6		13,000 円
	7 ～ 29		11,000 円
	30 ～		8,000 円	お問い合わせ下さい
糞便 pH 測定	1 ～ 3	検体	4,500 円	17 営業日～
	4 ～ 6		3,500 円
	7 ～ 29		3,000 円
	30 ～		2,500 円	お問い合わせ下さい
糞便水分測定	1 ～ 3	検体	4,000 円	17 営業日～
	4 ～ 6		3,000 円
	7 ～ 29		2,500 円
	30 ～		2,000 円	お問い合わせ下さい
糞便中 IgA 分析（ヒト）	1 ～ 3	検体	41,000 円	17 営業日～
	4 ～ 6		24,000 円
	7 ～ 29		16,000 円
	30 ～		11,000 円	お問い合わせ下さい
糞便　混練作業※²、³	1	検体	2,000 円～	お問い合わせ下さい

※1 協力企業等の第三者に再委託する可能性があります。
※2 均一化のための糞便の混練作業です。多量の検体を作業する場合、別途、処分費が必要となることがあります。詳細は当社までお問い合わせ下さい。
※3 同一検体を複数の容器でお送りいただき、それらをまとめて秤量する場合、混練作業が必要な場合があります。

項目名	最低必要量（試験項目ごと）	目安	最適な容器
・有機酸 (短鎖脂肪酸) ・胆汁酸・腐敗産物・アンモニア・pH ・IgA	・ヒト糞便：各200 mg ・マウス糞便／腸管内容物：各60 mg	・ヒト糞便：グリーンピース2～3粒・マウス糞便/腸管内容物：5～10粒 (小豆2粒)	・2 mL スクリューキャップチューブ

ご依頼前の同意事項

・糞便中有機酸 (短鎖脂肪酸) 分析は、検体をスプーン型、保存液なしのタイプで採取し冷凍、あるいはメタボロキーパー®で採取し冷蔵または室温(冷蔵推奨) でお送り下さい。
・糞便中有機酸 (短鎖脂肪酸) 分析以外の分析をご依頼の場合は、スプーン型、保存液なしのタイプで採取し、冷凍でお送り下さい。
・有機酸 (短鎖脂肪酸) 分析、腐敗産物は、採便後直ちに冷凍保存することで、分析対象物質が1ヶ月間程度は安定であることを確認しています。
・輸送時に万が一、解凍した場合、これに伴う梱包材の軟化や破断による汚染が考えられます。発泡スチロール製の容器に梱包いただき、漏洩にご注意
下さい。
・哺乳類・鳥類などの野生動物 (野良も含む) 由来の検体は、送付前にお客様の元で加熱処理（85℃ 15分以上）をお願いします。
・ご依頼事項の同意事項 (共通) を必ずご確認下さい。
・試験時に発生した抽出物などの中間産物は、提供しておりません。

分析ごとの同意事項、ご依頼前の同意事項（共通）およびテクノスルガ・ラボ基本約款を確認しました。

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303_Feces_physics_V20.zip

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生体 DNA抽出

tslseeqadmin — Tue, 07 Nov 2023 11:36:58 +0000

生体 DNA抽出

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生体関連

特長


糞便、唾液、皮膚拭取物などからDNAを抽出し濃度測定結果とともに納品

概要

当社標準プロトコルに基づき生体由来検体からDNAを抽出し納品します。

受入可能な検体

検体区分	由来	検体の種類※²
A 区分：糞便検体※¹	ヒト	糞便
	マウス、ラットなどの実験動物類	糞便、腸管内容物
	ブタ、ウシ、ウマなどの家畜類	糞便、腸管内容物、ルーメン液
	ニワトリなどの家禽類	糞便、腸管内容物
	イヌ、ネコなどのペット類	糞便
	魚類、昆虫、その他	糞便、腸管内容物
B 区分：その他生体由来検体	ヒト（その他動物種はご相談下さい）	唾液、プラーク
		皮膚拭取物
		膣内拭取物

※1　糞便からのDNA抽出については、技術情報『当社での糞便からのDNA抽出方法』をご参照下さい。
※2　血液、臓器、細胞組織およびそれらが付着した検体の受け入れはできません。
哺乳類・鳥類などの野生動物 (野良も含む) 由来の検体は、送付前にお客様の元で加熱処理（85℃ 15分以上）をお願いします。

必要検体量・送付方法

検体の種類			必要量	留意点および送付方法
A区分	糞便、腸管内容物、ルーメン液	気密性の高い容器	0.2 ～ 0.5 g	採取後速やかに冷凍保存、冷凍輸送
		糞便採取容器 ( 保存液あり ) メタボロキーパー※		採取後速やかに冷蔵保存冷蔵輸送推奨、常温輸送可
B区分	A 区分以外口腔内容物 (唾液、プラーク ) 皮膚拭取物など	スワブ 1.5 mL チューブなど	0.2 ～ 1 mL ( 唾液 )	唾液、舌苔、口腔粘膜、プラークを採取し、速やかに冷凍保存、冷凍輸送
				綿棒やコットンなどで広範囲を拭き取った検体は、極少量の適切な溶液（PBS、生理食塩水、滅菌水など）に移し、速やかに冷蔵保存、冷蔵輸送
		メタフロキーパー（皮膚、唾液）※		採取後速やかに冷蔵保存冷蔵輸送推奨、常温輸送可

※保存液は捨てずに検体を採取し、採取後も採取容器は冷凍せず、保存液の中に検体が入った状態でご送付下さい。冷凍する場合の保管温度帯は腸内環境分析用糞便採取キット・採取容器のページをご参照下さい。

生体由来検体の返送

ガイド「生体由来検体の返送に関するご案内」をご確認下さい。

作業の流れ


検体の秤量（オプション）

破砕

精製

濃度測定

仕様

使用機器またはキット	内容
・ GENE PREP STAR PI-480 および NR201	A 区分検体から得た粗抽出 DNA の精製を実施します。
・ MORA-EXTRACT	B 区分検体からの抽出～精製を実施します。

納品内容

TEバッファーに溶解したDNAを、70 μL以上納品します。吸光度測定によるDNA濃度測定結果を報告します。

報告納品内容	形式
DNA 抽出物	マイクロチューブ
DNA 濃度測定結果	Excel ファイル

報告書サンプル

価格納期

試験項目	区分	検体数	単位	単価（税抜）	目安納期
DNA 抽出	A 区分	1	検体	11,000 円	10 営業日～
DNA 抽出	B 区分	1	検体	17,000 円	15 営業日～

オプション

■仕様

試験項目	内容
秤量	DNA 抽出に使う検体量を秤量し、抽出を行います。 ( ※リアルタイムPCR 解析に使用する場合は必須)
PCR 増幅確認	16S rDNA のユニバーサルプライマーを用いてPCR 増幅の有無を確認します。
二本鎖 (ds) DNA 濃度測定	蛍光法によりQubit またはマイクロプレートリーダーで測定します。
糞便　混錬作業	均一化のための糞便の混錬作業です。同一検体を複数の容器でお送りいただき、それらをまとめて秤量する場合、混錬作業が必要な場合があります。

■納品内容

報告納品内容	形式
秤量結果	Excel ファイル
PCR 増幅確認結果	jpg ファイル
二本鎖 (ds) DNA 濃度測定結果	Excel ファイル

■価格・納期

追加試験項目	検体数	単位	単価（税抜）	目安納期
秤量	1	検体	1,000 円～	＋ 2 営業日～
PCR 増幅確認	1	検体	6,000 円	＋ 5 営業日～
二本鎖 (ds) DNA 濃度測定 ( 蛍光法 )	1 ～ 4	検体	6,000 円	＋ 2 営業日～
	5 ～ 23		3,000 円
	24 ～		2,000 円
糞便　混錬作業※	1	検体	2,000 円～	お問い合わせ下さい

※ 均一化のための糞便の混練作業です。多量の検体を作業する場合、別途、処分費が必要となることがあります。詳細は当社までお問い合わせ下さい。

ご依頼前の同意事項

・ DNA抽出物の納品には、別途送料が必要となる場合がございます。
・糞便検体でリアルタイムPCR解析、または糞便理化学分析を同時あるいは追加で行う場合は、保存液入りの糞便採取容器は使用できません。保存液なしの採取容器あるいはメタボロキーパー®をご使用下さい。
・解凍に伴う梱包材の軟化や破断による汚染が考えられるため、発泡スチロールなどに梱包いただき、漏洩にご注意下さい。
・秤量および他試験項目を同時に行う場合には、検体の必要量が変わりますのでお問い合わせ下さい。
・本試験項目は、当社の受託解析サービス (アンプリコンシーケンス解析、リアルタイムPCR解析など) の基本サービスであり、当社の受託解析サービス以外での解析における必要なDNA量および品質を保証するものではありません。
・当社において、ショットガンメタゲノム解析での最適なDNA抽出方法の検証は行っておりません。
・ DNAの収量は、検体量および保存状態に依存します。あらかじめご了承下さい。
・ DNAの収量評価については、オプションサービスをご依頼下さい。
・糞便の場合、DNA必要量がお決まりの場合には事前にご相談下さい。
・哺乳類・鳥類などの野生動物 (野良も含む) 由来の検体は、送付前にお客様の元で加熱処理（85℃ 15分以上）をお願いします。
・ご依頼前の同意事項 (共通) を必ずご確認下さい。

生体A区分のご依頼書はこちら

分析ごとの同意事項、ご依頼前の同意事項（共通）およびテクノスルガ・ラボ基本約款を確認しました。

ファイルをダウンロードする
214A_DNA-extraction_TypeA_V19.zip

生体B区分のご依頼書はこちら

分析ごとの同意事項、ご依頼前の同意事項（共通）およびテクノスルガ・ラボ基本約款を確認しました。

ファイルをダウンロードする
214B_DNA-extraction_TypeB_V19.zip

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生体A DNA 抽出 (JMBC 推奨プロトコル)

tslseeqadmin — Tue, 07 Nov 2023 11:36:57 +0000

生体A DNA 抽出 (JMBC 推奨プロトコル)

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生体関連

特長


JMBC（日本マイクロバイオームコンソーシアム）推奨プロトコルに基づき、DNAを抽出し濃度測定結果とともに納品

概要

JMBCが推奨する糞便メタゲノム解析推奨プロトコル^1,2)に基づきDNAを抽出します。

受入可能な検体

検体由来	由来	検体の種類※
A 区分：糞便検体	ヒト	糞便

※ 血液、臓器、細胞組織およびそれらが付着した検体の受け入れはできません。
※ ヒト以外の糞便検体でのDNA抽出はご相談下さい。

必要検体量・送付方法

検体の種類			必要量	留意点および送付方法
A区分	糞便	気密性の高い容器	0.2 ～ 0.5 g	採取後速やかに冷凍保存、冷凍輸送
		糞便採取容器 ( 保存液あり ) メタボロキーパー®		採取後速やかに冷蔵保存冷蔵輸送推奨、常温輸送可

・保存液は捨てずに検体を採取し、採取後も採取容器は冷凍せず、保存液の中に検体が入った状態でご送付下さい。
・冷凍する場合の保管温度帯は腸内環境分析用糞便採取キット・採取容器のページをご参照下さい。

生体由来検体の返送

ガイド「生体由来検体の返送に関するご案内」をご確認下さい。

作業の流れ


検体の秤量（オプション）

破砕

精製

濃度測定

仕様

使用機器またはキット	内容
・ ISOSPIN Fecal DNA	糞便からの DNA 抽出～精製を実施します。

納品内容

TEバッファーに溶解したDNAを70 μL以上納品します。吸光度測定によるDNA濃度測定結果を報告します。

報告納品内容	形式
DNA 抽出物	マイクロチューブ
DNA 濃度測定結果	Excel ファイル

報告書サンプル

価格納期

試験項目	区分	検体数	単位	単価（税抜）	目安納期
DNA抽出 (JMBC 推奨プロトコル )	A 区分	1	検体	12,000 円	15 営業日～

参考文献

(1)
Tourlousse DM, Narita K, Miura T, Sakamoto M, Ohashi A et al . Validation and standardization of DNA extraction and library construction methods for metagenomics-based human fecal microbiome measurements.Microbiome 2021;9:95.
(2) JMBC糞便メタゲノム解析推奨プロトコル ver2.1.
http://www.jmbc.life/news/images/SOPv1.2.pdf

オプション

■仕様

試験項目	内容
秤量	DNA 抽出に使う検体量を秤量し、抽出を行います。 ( ※リアルタイムPCR 解析に使用する場合は必須)
PCR 増幅確認	16S rDNA のユニバーサルプライマーを用いてPCR 増幅の有無を確認します。
二本鎖 (ds) DNA 濃度測定	蛍光法によりQubit またはマイクロプレートリーダーで測定します。
糞便　混錬作業	均一化のための糞便の混錬作業です。同一検体を複数の容器でお送りいただき、それらをまとめて秤量する場合、混錬作業が必要な場合があります。

■納品内容

報告納品内容	形式
秤量結果	Excel ファイル
PCR 増幅確認結果	jpg ファイル
二本鎖 (ds) DNA 濃度測定結果	Excel ファイル

■価格・納期

追加試験項目	検体数	単位	単価（税抜）	目安納期
秤量	1	検体	1,000 円～	＋ 2 営業日～
PCR 増幅確認	1	検体	6,000 円	＋ 5 営業日～
二本鎖 (ds) DNA 濃度測定 ( 蛍光法 )	1 ～ 4	検体	6,000 円	＋ 2 営業日～
	5 ～ 23		3,000 円
	24 ～		2,000 円
糞便　混錬作業※	1	検体	2,000 円～	お問い合わせ下さい

ご依頼前の同意事項

・ DNA抽出物の納品には、別途送料が必要となる場合がございます。
・糞便検体でリアルタイムPCR解析、または糞便理化学分析を同時あるいは追加で行う場合は、保存液入りの糞便採取容器は使用できません。保存液なしの採取容器をご使用下さい。
・解凍に伴う梱包材の軟化や破断による汚染が考えられるため、発泡スチロールなどに梱包いただき、漏洩にご注意下さい。
・秤量および他試験項目を同時に行う場合には、検体の必要量が変わりますのでお問い合わせ下さい。
・本試験項目は、当社の受託解析サービス (アンプリコンシーケンス解析、リアルタイムPCR解析など)の基本サービスであり、当社の受託解析サービス以外での解析における必要なDNA量および品質を保証するものではありません。
・当社において、ショットガンメタゲノム解析での最適なDNA抽出方法の検証は行っておりません。
・ DNAの収量は、検体量および保存状態に依存します。あらかじめご了承下さい。
・ DNAの収量評価については、オプションサービスをご依頼下さい。
・糞便の場合、DNA必要量がお決まりの場合には事前にご相談下さい。
・哺乳類・鳥類などの野生動物 (野良も含む) 由来の検体は、送付前にお客様の元で加熱処理（85℃ 15分以上）をお願いします。
・ご依頼前の同意事項 (共通) を必ずご確認下さい。

分析ごとの同意事項、ご依頼前の同意事項（共通）およびテクノスルガ・ラボ基本約款を確認しました。

ファイルをダウンロードする
214A_DNA-extraction_TypeA_V19.zip

投稿生体A DNA 抽出 (JMBC 推奨プロトコル) は TechnoSuruga Laboratory Co.,Ltd. に最初に表示されました。

生体アンプリコンシーケンス解析 (JMBC 推奨プロトコル)

tslseeqadmin — Tue, 07 Nov 2023 11:36:55 +0000

生体アンプリコンシーケンス解析 (JMBC 推奨プロトコル)

ホーム
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群集構造解析
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生体関連

※MiSeq®はIllumina社の登録商標です。

特長


JMBC (日本マイクロバイオームコンソーシアム)推奨プロトコルに基づき、糞便中の細菌叢を解析

検体のDNA抽出からデータ解析までの一括対応、抽出済DNAでの受入、fastqデータ納品 (解析なし) など、多様なニーズに対応 (1検体から申込み可能)

DNA抽出からデータ解析まで全て当社内で作業

解析ソフトウェアは2種類から選択可能

セット1：Metagenome@KIN (データベース『RDP』あるいは『テクノスルガ・ラボ微生物同定データベース』)

セット2：QIIME2 (データベース『Greengenes』あるいは『SILVA』)

概要

JMBC が推奨する糞便メタゲノム解析推奨プロトコル^1,2)に基づき、アンプリコンシーケンス解析を実施します。

受入可能な検体

検体区分（種類）	由来	検体の種類※	対象
A区分：糞便検体	ヒト	糞便	細菌のDNA
DNA抽出物	ー	PCR増幅が確認されたJMBC推奨プロトコルに従い抽出されたDNA抽出物 PCR 増幅が確認できたことを示す電気泳動像を必ずご提供下さい。	細菌のDNA

※ 血液、臓器、細胞組織およびそれらが付着した検体の受け入れはできません。
※ ヒト以外の糞便検体でのDNA抽出はご相談下さい。

必要検体量・送付方法

検体の種類			必要量	留意点および送付方法
A区分	糞便	気密性の高い容器	0.2 ～ 0.5 g	採取後速やかに冷凍保存、冷凍輸送
		糞便採取容器 (保存液あり) あるいはメタボロキーパー®※		採取後速やかに冷蔵保存冷蔵輸送推奨、常温輸送可
DNA抽出物			濃度　5 ng/µL 総量　30 µL 以上	抽出後速やかに冷蔵保存、冷蔵輸送 PCR 増幅が確認できたことを示す電気泳動像を必ずご提供下さい。

※保存液は捨てずに検体を採取し、採取後も採取容器は冷凍せず、保存液の中に検体が入った状態でご送付下さい。保管温度帯は腸内環境用糞便採取キット・採取容器のページをご参照下さい。

生体由来検体の返送

ガイド「生体由来検体の返送に関するご案内」をご確認下さい。

解析の流れ


DNA抽出/精製

PCR増幅/精製

PCR産物の定量

シーケンス配列決定^※

ペアエンド配列アッセンブル

フィルタリング、キメラチェック

データ解析

※　JMBC 推奨プロトコルはシーケンスによる配列決定までとなります。

仕様

対象微生物		細菌
解析対象		DNA
遺伝子領域		16S rDNA V3 ～ V4 領域
リード数*¹		3万リード以上 / 検体
解析機種		MiSeq i100シリーズ
データ解析*²	セット1 ： Metagenome@KIN	RDP*³ およびテクノスルガ・ラボ「微生物同定データベース」
	セット2 ： QIIME2⁴ ⁵	Greengenes database*³
		SILVA database*³

*1　3万リード取得を目安に解析を実施しますが、獲得できる配列数は検体の性状により変動します。
*2　データ解析は、セット1またはセット2のどちらかをご選択下さい。
*3　RDP (Ribosomal Database Project)、Greengenes databaseおよびSILVA databaseは公共の解析データベースです。
*4　セット2 (QIIME2) は一次解析までの報告です。二次解析 (多様性解析、統計解析) は、別途追加解析のご指示を下さい。
*5　GreengenesまたはSILVAのどちらかをご選択下さい。データベースの違いによる結果の違いについては、当社では考察しません。

納品内容

報告内容	形式
次世代シーケンサー ( NGS ) によるシーケンス生データ	fastq ファイル
次世代シーケンサー ( NGS ) によるシーケンスデータ( クオリティーフィルタリング、キメラチェック後 )	fasta ファイル
データ解析結果※	csv ファイル、 html ファイル

※ 詳細は「アンプリコンシーケンスデータ解析 (Metagenome@KIN)」をご参照下さい。
※ ご依頼内容や検体数によって納品されないファイルがあります。

■ 報告サンプル (セット1：Metagenome@KIN)

ドーナツグラフ		検体の菌叢を構成する帰属分類群を界（内側）～属または種（外側）へ一つの図として表示します。htmlファイルなので、グラフにカーソルを合わせ、クリックすることで分類群の名前や分類階級をハイライトすることもできます。群集構造全体の理解を視覚的にサポートします。
解析例
検体間比較グラフ		全検体の、ある分類階級における帰属分類群の内訳を並べて表示します。検体間の群集構造の違いを俯瞰する際に便利です。
クラスター解析		デンドログラムおよび、ヒートマップ画像が分類階級ごとに作成されます。
主成分分析		主成分の二次元プロット画像が分類階級ごとに作成されます。検体間の相違を散布図で示します。

報告内容		形式
次世代シーケンサー ( NGS ) によるシーケンス生データ		fastq ファイル
QIIME2 出力データファイルデータ解析 ( 一次解析 ) 結果※	代表配列とリード数の一覧	qzv ファイル
	相同性検索結果 ( 表、バーチャート )

■ 報告サンプル (セット2：QIIME2)

価格・納期

試験項目	依頼形態	単価（税抜）*²	目安納期（DNA解析）*¹
アンプリコンシーケンス解析（JMBC 推奨プロトコル) 細菌 16S rDNA V3～V4	検体にてご依頼の場合	24,000円／検体	24 営業日～
	DNA抽出物にてご依頼の場合	18,000円／検体	22 営業日～
	fastqファイル納品の場合	23,500円／検体	24 営業日～
	DNA抽出物にてご依頼、fastqファイル納品の場合	17,500円／検体	22 営業日～

セット2をご選択いただいた場合、多様性解析や統計解析(二次解析)が可能です。費用は一式＋30,000円 (税抜) 納期は＋5営業日となります。

*1　 PCR増幅が確認されないなど検体の性質に帰因する不具合により作業のやり直しが発生する場合は納期を延長させていただく場合があります。
*2　リアルタイムPCR解析などを同時にご依頼いただく場合、DNA抽出の重複費用として1検体あたり6,000円（税抜）を減額します。

従来機「MiSeq」をご利用希望の方

※異なるシーケンサープラットフォームの利用による結果の違いについては、当社では考察しません。あらかじめご了承ください。

■価格・納期

試験項目	単価（税抜）	目安納期（DNA解析）
アンプリコンシーケンス解析（JMBC 推奨プロトコル) 細菌 16S rDNA V3～V4	35,000円／検体	40営業日～

セット2をご選択いただいた場合、多様性解析や統計解析(二次解析)が可能です。費用は一式＋30,000円 (税抜) 納期は＋5営業日となります。

■仕様

対象微生物		細菌・アーキア
解析対象		DNA
遺伝子領域		16S rDNA V3 ～ V4 領域（細菌）
リード数*¹		1 万リード以上／検体
解析機種		従来機MiSeq
データ解析*²	セット1 ：Metagenome@KIN	RDP*⁵ およびテクノスルガ・ラボ「微生物同定データベース」
	セット2 ：QIIME2⁴ ⁵	Greengenes database³またはSILVA database³

*1　クオリティーフィルタリング、キメラチェック後のリード数です。
*2　データ解析は、セット1またはセット2のどちらかをご選択下さい。
*3　RDP (Ribosomal Database Project)、Greengenes databaseおよびSILVA databaseは公共の解析データベースです。
*4　セット2 (QIIME2) は一次解析までの報告です。二次解析 (多様性解析、統計解析) は、別途追加解析のご指示を下さい。
*5　GreengenesまたはSILVAのどちらかをご選択下さい。データベースの違いによる結果の違いについては、当社では考察しません。

参考文献

１）Tourlousse DM, Narita K, Miura T, Sakamoto M, Ohashi A et al . Validation and standardization of DNA extraction and library construction methods for metagenomics-based human fecal microbiome measurements. Microbiome 2021;9:95.

２）JMBC 糞便メタゲノム解析推奨プロトコル ver2.1.
http://www.jmbc.life/news/images/SOPv1.2.pdf

ご依頼前の同意事項

・メディア（DVD-R）による配送納品のみとなります。
・ご依頼前の同意事項（共通）を必ずご確認下さい。
・お預かりした検体を返送する場合、当社は試験前の検体と同等の状態を保証するものではありません。
・ご依頼前の解析手法などの選択についてのご相談には可能な範囲で対応しますが、最終的なご判断はお客様の責任にてお願いいたします。
・哺乳類・鳥類などの野生動物 (野良も含む) 由来の検体は、送付前にお客様の元で加熱処理（85℃ 15分以上）をお願いします。

▼ MiSeq i100シリーズでの解析（推奨）

分析ごとの同意事項、ご依頼前の同意事項（共通）およびテクノスルガ・ラボ基本約款を確認しました。

ファイルをダウンロードする
211A-2_NGS_living_TypeA_i100_V2.zip

▼ 従来機MiSeqでの解析

分析ごとの同意事項、ご依頼前の同意事項（共通）およびテクノスルガ・ラボ基本約款を確認しました。

ファイルをダウンロードする
211A_NGS_living_TypeA_V20.zip

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T-RFLPフローラ解析 (MN法)

tslseeqadmin — Tue, 07 Nov 2023 11:36:54 +0000

T-RFLPフローラ解析 (MN法)

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群集構造解析
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生体関連

特長


T-RFLPフローラ解析 (Nagashima法) を継承した1種類の制限酵素による細菌叢解析

培養を介さず検体のDNAを対象として解析するため、難培養微生物も検出可能

Bifidobacterium 属、 Bacteroides 属などヒト腸内細菌叢の主要な分類群をOTU化して構成比率を比較

安価で迅速なMN-1法と、追加解析にも対応可能なMN-2法をご用意

MN法の結果は、アンプリコンシーケンスの結果と正の相関

概要

T-RFLP (Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism) は、末端蛍光標識したプライマーセットでPCR増幅したDNAを制限酵素処理後、その断片多型 (検出される蛍光ピークの数、強度と分子量) から細菌叢を推定します。微生物の分類体系がDNA塩基配列の差異と関係すること、それが制限酵素の切断パターンとして現れることを利用しています。
MN法はNagashima法^1,2)を改変し、ヒト腸内細菌叢に特化した解析手法です。得られた断片多型をBifidobacterium属、Bacteroides属などヒト腸内細菌叢の主要な分類群としてOTU (Operational Taxonomic Unit) 化し、その構成比率を一覧表およびバーチャートとして出力します。
DNA抽出物を未精製のまま解析するMN-1法、DNA抽出物を精製後に解析するMN-2法の2種類があります。

各OTUの分類群と推定される菌種一覧

▼各OTUの分類群と推定される菌種一覧（クリックするとPDFファイルが開きます）

試験項目	概要
MN-1 法	当社糞便採取容器「ブラシ型」に特化した、安価で迅速な解析サービスです。DNA 抽出物の精製工程を経ないため、DNA 抽出物の返送や追加試験 ( 他の解析サービス) はご利用いただけません。 DNA 抽出物の返送や追加試験をご希望の方は、MN-2 法をご選択下さい。
MN-2 法	当社糞便採取容器「ブラシ型」以外の容器にも対応した解析サービスです。使用可能な糞便採取容器の種類は、「価格・納期」の項をご参照下さい。 DNA 精製まで行うため、DNA 抽出物の返送や追加試験もご利用いただけます。注意：「ブラシ型」では採便した糞便を秤量できないため、リアルタイムPCR の追加試験はできません。

参考文献

(1)
Nagashima K, Hisada T, Sato M, Mochizuki J. Application of new primer-enzyme combinations to terminal restriction fragment length polymorphism profiling of bacterial populations in human feces. Appl Environ Microbiol 2003;69:1251-1262.
(2)
Nagashima K, Mochizuki J, Hisada T, Suzuki S, Shimomura K. Phylogenetic Analysis of 16S Ribosomal RNA Gene Sequences from Human Fecal Microbiota and Improved Utility of Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism Profiling. Bioscience and Microflora 2006;25:99-107.

受入可能な検体

検体区分	由来	検体の種類	対象
A区分：糞便検体	ヒト	糞便	細菌のDNA

血液、臓器、細胞組織およびそれらが付着した検体の受け入れはできません。

必要検体量・送付方法

検体の種類			必要量	留意点および送付方法
A区分	ヒト糞便	【MN-1 法／ MN-2 法】糞便採取容器ブラシ型 (保存液あり)	-	採取後速やかに冷蔵保存冷蔵輸送推奨、常温輸送可
		【MN-2 法】メタボロキーパー®	-	採取後速やかに冷蔵保存冷蔵輸送推奨、常温輸送可
		【MN-2 法】気密性の高い容器	0.2 ～ 0.5 g	採取後速やかに冷凍保存、冷凍輸送
			使用可能な糞便採取容器については、「価格・納期」の項をご参照下さい

保存液は捨てずに検体を採取し、採取後も採取容器は冷凍せず、保存液の中に検体が入った状態でご送付下さい。冷凍する場合の保管温度帯は腸内環境分析用糞便採取キット・採取容器のページをご参照下さい。

生体由来検体の返送

糞便採取容器「ブラシ型」を使いご依頼頂いた場合、元検体の返送はできません。

ガイド「生体由来検体の返送に関するご案内」をご確認下さい。

解析の流れ

MN-1法 (DNA精製なし)


DNA抽出

DNA精製なし

蛍光標識したプライマーでPCR増幅

制限酵素処理

フラグメント解析

MN-1法 (DNA精製あり)


DNA抽出

DNA精製あり

蛍光標識したプライマーでPCR増幅

制限酵素処理

フラグメント解析

仕様・納品内容

DNAシーケンサー (ABI PRISM 3500xl DNA Genetic Analyzer) で検体の細菌叢に由来する16S rDNA部分塩基配列のフラグメント解析を行います。
追加のデータ解析 (クラスター分析、主成分分析、群間比較 (箱ひげ図、ベン図) ) につきましては、「統計解析ソフトRによるデータ解析」の章をご参照下さい。

報告内容	形式
各 OTU のピーク面積比、グラフ	Excel ファイル

報告サンプル

価格・納期

糞便理化学分析と同時依頼の場合は、お問い合わせ下さい。

試験項目	検体数	単位	糞便採取容器の種類	単価（税抜）	目安納期
T-RFLP フローラ解析（MN-1 法）	1	検体	・ブラシ型／保存液あり　(FS-0016、FS-0017)	12,000 円	14 営業日
				10,000 円	長納期 20 営業日～
T-RFLP フローラ解析（MN-2 法）	1	検体	・ブラシ型／保存液あり　(FS-0016、FS-0017) ・メタボロキーパー® 　( FS-0015 ) ・気密性の高い容器 ( 凍結糞便 )	15,000 円	16 営業日
				13,000 円	長納期 21 営業日～

DNA抽出物の返送をご希望の場合には、MN-2法をお選び下さい。詳しくはページ上部の「概要」をご参照下さい。

ご依頼前の同意事項

・ご依頼前の同意事項（共通）を必ずご確認下さい。
・お預かりした検体を返送する場合、当社は試験前の検体と同等の状態を保証するものではありません。
・ご依頼前の解析手法などの選択についてのご相談には可能な範囲で対応しますが、最終的なご判断はお客様の責任にてお願いいたします。
・哺乳類・鳥類などの野生動物 (野良も含む) 由来の検体は、送付前にお客様の元で加熱処理（85℃ 15分以上）をお願いします。

分析ごとの同意事項、ご依頼前の同意事項（共通）およびテクノスルガ・ラボ基本約款を確認しました。

ファイルをダウンロードする
301M_T-RFLP（MN法）_V6.zip

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生体リアルタイムPCR解析 (定量)

tslseeqadmin — Tue, 07 Nov 2023 11:36:53 +0000

生体リアルタイムPCR解析 (定量)

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群集構造解析
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生体関連

特長


当社のオリジナルを含む多数のプライマーセットを保有

腸内細菌、口腔内細菌、皮膚常在菌などの微生物を対象

微量な検体からでも正確な推定が可能

概要

検体中に含まれる特定の帰属分類群の遺伝子を、リアルタイムPCRシステムにより指数関数的に増幅するDNAの量をリアルタイムにモニタリングし、定量します。
全細菌や全アーキアのコピー数と比較することで、検体中の標的菌群の割合を推定可能です。

受入可能な検体

検体区分（種類）	由来	検体の種類※	対象
A区分：糞便検体	ヒト	糞便	細菌・アーキア、カビ・酵母の DNA
	マウス、ラットなどの実験動物類	糞便、腸管内容物
	ブタ、ウシ、ウマなどの家畜類	糞便、腸管内容物、ルーメン液
	ニワトリなどの家禽類	糞便、腸管内容物
	イヌ、ネコなどのペット類	糞便
	魚類、昆虫、その他	糞便、腸管内容物
B 区分：その他生体由来検体	ヒト（その他動物種はご相談下さい）	唾液、プラーク
		皮膚拭取物
		膣内拭取物
DNA 抽出物	－	PCR 増幅が確認されたDNA 抽出物 PCR 増幅が確認できたことを示す電気泳動像を必ずご提供下さい。

※　血液、臓器、細胞組織およびそれらが付着した検体の受け入れはできません。
哺乳類・鳥類などの野生動物 (野良も含む) 由来の検体は、送付前にお客様の元で加熱処理（85℃ 15分以上）をお願いします。

必要検体量・送付方法

検体の種類			必要量	留意点および送付方法
A区分	糞便、腸管内容物、ルーメン液	気密性の高い容器	0.2 ～ 0.5 g	採取後速やかに冷凍保存、冷凍輸送
		メタボロキーパー®※		採取後速やかに冷蔵保存冷蔵輸送推奨、常温輸送可・メタボロキーパー®を用いてのご依頼の場合には糞便中有機酸 (短鎖脂肪酸) 分析が必要になります。
B区分	A 区分以外口腔内容物 ( 唾液、プラーク ) 皮膚拭取物など	スワブ 1.5 mL チューブなど	0.2 ～ 1 mL ( 唾液 )	唾液、舌苔、口腔粘膜、プラークを採取し、速やかに冷凍保存、冷凍輸送
				綿棒やコットンなどで広範囲を拭き取った検体は、極少量の適切な溶液 (PBS、生理食塩水、滅菌水など) に移し、速やかに冷蔵保存、冷蔵輸送
DNA 抽出物			濃度： 10 ng/µL 容量： 30 µL (1 プライマー追加ごとに＋ 15 µL 以上 )	抽出後速やかに冷蔵保存、冷蔵輸送 PCR 増幅が確認できたことを示す電気泳動像を必ずご提供下さい。

※ 保存液は捨てずに検体を採取し、採取後も採取容器は冷凍せず、保存液の中に検体が入った状態でご送付下さい。保管温度帯は腸内環境分析用糞便採取キット・採取容器のページをご参照下さい。

生体由来検体の返送

ガイド「生体由来検体の返送に関するご案内」をご確認下さい。

作業の流れ


DNA抽出

DNA精製

PCR増幅（インターカレーター法）

PCR増幅産物　モニタリング

仕様

リアルタイムPCR装置を用いて、ご指定いただいたプライマーでPCR増幅し、目的とする微生物のDNA量(コピー数)を絶対定量します。

当社保有プライマー

全菌数

全真正細菌、全アーキア、カビ・酵母 ITS　［詳細はこちら］

腸内アーキア

Methanobacteriaceae 科　［詳細はこちら］

腸内細菌

Clostridium cluster XVIII、Clostridium perfringens （ウェルシュ菌）、Clostridium butyricum、Clostridium leptum、
Eggerthella 属、Enterococcus 属、Enterococcus faecalis、Fusicatenibacter saccharivorans、Fusobacterium 属、
Fusobacterium varium、Klebsiella pneumoniae、Lactobacillus 属、
Lacticaseibacillus casei、Lactobacillus gasseri、Lactobacillus mucosae、Parabacteroides 属、Prevotella 属、Streptococcus 属、Sutterella 属、Veillonella 属、Verrucomicrobia 門　［詳細はこちら］

口腔内細菌

Actinomyces 属、Aggregatibacter actinomycetemcomitans、Bacteroides fragilis、Campylobacter 属、Fusobacterium 属、Leptotrichia 属、Prevotella 属、Porphyromonas gingivalis、Streptococcus mutans、Streptococcus intermedius、
Staphylococcus aureus、Treponema denticola、Tannerella forsythia、Veillonella 属　［詳細はこちら］

皮膚常在菌

Acinetobacter 属、Staphylococcus aureus　［詳細はこちら］

膣内菌

Gardnerella vaginalis　［詳細はこちら］

食品

酢酸菌、Alicyclobacillus 属、Bacillus subtilis、Levilactobacillus brevis、
Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus、Lactiplantibacillus paraplantarum、Lactiplantibacillus plantarum、
Streptococcus thermophilus　［詳細はこちら］

価格・納期

試験項目	内容（解析例）		単位	単価（税抜）	目安納期
リアルタイム PCR 解析 ( 定量 )	検体数 1	1 プライマーの場合	検体	45,000 円	15 営業日～
	検体数 2	2 プライマーの場合		45,000 円
	検体数 5	2 プライマーの場合		31,000 円
	検体数 10	2 プライマーの場合		26,000 円
＜オプション＞プライマー設計	-		式	45,000 円	＋ 10 営業日
＜オプション＞　スタンダード作製	-		式	104,000 円	お問い合わせ下さい

参考文献

(1)
Nakayama J, Tanaka S, Songjinda P, Tateyama A, Tsubouchi M et al. Analysis of infant intestinal microbiota by various kinds of molecular approaches -Toward large scale epidemiological investigations correlating allergy development with intestinal microbiota-. J Intestinal Microbiol 2007;21:129–142.
(2)
Farrelly V, Rainey FA, Stackebrandt E. Effect of genome size and rrn gene copy number on PCR amplification of 16S rRNA genes from a mixture of bacterial species. Appl Environ Microbiol 1995;61:2798–2801.
(3)
Fogel G, Collins C, Li J, Brunk C. Prokaryotic genome size and SSU rDNA copy number: estimation of microbial relative abundance from a mixed population. Microb Ecol 1999;38:93–113.

ご依頼前の同意事項

・新たにプライマーを合成する場合、合成費用や菌株購入費用、スタンダード作製費用が必要となります。
・リアルタイムPCR解析の16S rRNA遺伝子は，細菌種により保有している量 (コピー数) が異なるため、16S rDNA のコピー数が実際の細菌数と等しいわけではない点を考慮すべきであると考えられています1-3)。
・哺乳類・鳥類などの野生動物 (野良も含む) 由来の検体は、送付前にお客様の元で加熱処理（85℃ 15分以上）をお願いします。
・ご依頼前の同意事項 (共通) を必ずご確認下さい。

生体A区分のご依頼書はこちら

分析ごとの同意事項、ご依頼前の同意事項（共通）およびテクノスルガ・ラボ基本約款を確認しました。

ファイルをダウンロードする
242A_realtime_living_TypeA_V17.zip

生体B区分のご依頼書はこちら

分析ごとの同意事項、ご依頼前の同意事項（共通）およびテクノスルガ・ラボ基本約款を確認しました。

ファイルをダウンロードする
242B_realtime_living_TypeB_V18.zip

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生体特異プライマーPCR解析 (定性)

tslseeqadmin — Tue, 07 Nov 2023 11:36:52 +0000

生体特異プライマーPCR解析 (定性)

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群集構造解析
/
生体関連

特長


当社のオリジナルを含む多数のプライマーセットを保有

腸内細菌、口腔内細菌、皮膚常在菌などの微生物を対象

様々な検体に対応

概要

検体中に含まれる特定の帰属分類群や特定機能遺伝子をターゲットにしたプライマーセットを用いて、PCR増幅、電気泳動を行い、目的塩基長のバンドが出現することを確認して定性を行う試験です。

受入可能な検体

検体区分（種類）	由来	検体の種類※	対象
A区分：糞便検体	ヒト	糞便	細菌・アーキア、カビ・酵母の DNA
	マウス、ラットなどの実験動物類	糞便、腸管内容物
	ブタ、ウシ、ウマなどの家畜類	糞便、腸管内容物、ルーメン液
	ニワトリなどの家禽類	糞便、腸管内容物
	イヌ、ネコなどのペット類	糞便
	魚類、昆虫、その他	糞便、腸管内容物
B 区分：その他生体由来検体	ヒト（その他動物種はご相談下さい）	唾液、プラーク
		皮膚拭取物
		膣内拭取物
DNA 抽出物	－	PCR 増幅が確認されたDNA 抽出物 PCR 増幅が確認できたことを示す電気泳動像を必ずご提供下さい。

※1　血液、臓器、細胞組織およびそれらが付着した検体の受け入れはできません。

必要検体量・送付方法

検体の種類			必要量	留意点および送付方法
A区分	糞便、腸管内容物、ルーメン液	気密性の高い容器	0.2 ～ 0.5 g	採取後速やかに冷凍保存、冷凍輸送
		糞便採取容器 (保存液あり)あるいは「メタボロキーパー®」※		採取後速やかに冷蔵保存冷蔵輸送推奨、常温輸送可
B区分	A 区分以外口腔内容物 ( 唾液、プラーク ) 皮膚拭取物など	スワブ 1.5 mL チューブなど	0.2 ～ 1 mL ( 唾液 )	唾液、舌苔、口腔粘膜、プラークを採取し、速やかに冷凍保存、冷凍輸送
				綿棒やコットンなどで広範囲を拭き取った検体は、極少量の適切な溶液 (PBS、生理食塩水、滅菌水など) に移し、速やかに冷蔵保存、冷蔵輸送
		メタフロキーパー※ (皮膚、唾液)		採取後速やかに冷蔵保存冷蔵輸送推奨、常温輸送可
DNA 抽出物			濃度： 10 ng/µL 容量： 30 µL (1 プライマー追加ごとに＋ 15 µL 以上 )	抽出後速やかに冷蔵保存、冷蔵輸送 PCR 増幅が確認できたことを示す電気泳動像を必ずご提供下さい。

保存液は捨てずに検体を採取し、採取後も採取容器は冷凍せず、保存液の中に検体が入った状態でご送付下さい。冷凍する場合の保管温度帯は腸内環境分析用糞便採取キット・採取容器のページをご参照下さい。

生体由来検体の返送

ガイド「生体由来検体の返送に関するご案内」をご確認下さい。

作業の流れ


DNA抽出

DNA精製

PCR増幅

電気泳動

判定

仕様

ご指定いただいたプライマーを用いてPCR増幅します。特異プライマーPCR増幅産物の有無をアガロースゲル電気泳動により確認し、電気泳動後のゲル画像を報告します。

当社保有プライマー

全菌数

全真正細菌、全アーキア、カビ・酵母 ITS　［詳細はこちら］

腸内アーキア

Methanobacteriaceae 科　［詳細はこちら］

腸内細菌

口腔内細菌

皮膚常在菌

Acinetobacter 属、Staphylococcus aureus　［詳細はこちら］

膣内菌

Gardnerella vaginalis　［詳細はこちら］

食品

価格・納期

試験項目	内容（解析例）		単位	単価（税抜）	目安納期
特異プライマーPCR 解析 ( 定性 )	検体数 1	1 プライマーの場合	検体	36,000 円	15 営業日～
	検体数 2	2 プライマーの場合		34,000 円
	検体数 2	3 プライマーの場合		38,000 円
	検体数 5	5 プライマーの場合		39,000 円
＜オプション＞プライマー設計	-		式	45,000 円	＋ 10 営業日

ご依頼前の同意事項

・新たにプライマーを合成する場合、合成費用が必要となります。
・陽性対象 (ポジティブコントロール) をあわせて実施する場合にはお問い合わせ下さい。
・ご依頼前の同意事項 (共通) を必ずご確認下さい。

生体A区分のご依頼書はこちら

分析ごとの同意事項、ご依頼前の同意事項（共通）およびテクノスルガ・ラボ基本約款を確認しました。

ファイルをダウンロードする
232A_specific_living_TypeA_V16.zip

生体B区分のご依頼書はこちら

分析ごとの同意事項、ご依頼前の同意事項（共通）およびテクノスルガ・ラボ基本約款を確認しました。

ファイルをダウンロードする
232B_specific_living_TypeB_V17.zip

投稿生体特異プライマーPCR解析 (定性) は TechnoSuruga Laboratory Co.,Ltd. に最初に表示されました。

生体関連 アーカイブ - TechnoSuruga Laboratory Co.,Ltd.

腸内環境分析用 糞便採取キット・採取容器

腸内環境分析用 糞便採取キット・採取容器

特長

概要

SDS

取扱説明書

製品内容

１，糞便採取キット

２，糞便採取容器

３，「メタボロキーパー® 」糞便採取キット

製品内容 (オプション)

１，楽流カップ WIDE

２，糞便採取シート

３，目隠しシール

４，保管箱

試験項目と使用可能な糞便採取容器

採便前後の糞便採取容器の保存と期限

採便後の糞便採取容器の保管条件

価格・納期

採便量の目安

ご使用上の注意

関連リンク

ご依頼前の同意事項

生体 アンプリコンシーケンス解析

生体 アンプリコンシーケンス解析

特長

概要

受入可能な検体

必要検体量・送付方法

生体由来検体の返送

解析の流れ

仕様

納品内容

■ 報告サンプル (セット1：Metagenome@KIN)

■ 報告サンプル (セット2：QIIME2)

価格・納期

従来機「MiSeq」をご利用希望の方

■価格・納期

■仕様

関連ページ

ご依頼前の同意事項

皮膚菌叢解析用採取キット メタフロキーパー (皮膚)

皮膚菌叢解析用採取キット メタフロキーパー (皮膚)

特長

概要

SDS

取扱説明書

製品内容

価格・納期

採取前後の採取容器の保存と期限 （菌叢を維持できる目安期間）

ご使用上の注意

動画【メタフロキーパーの使用方法】

関連リンク

ご依頼前の同意事項

糞便理化学分析

糞便理化学分析

特 長

概要

糞便中有機酸 (短鎖脂肪酸)分析

糞便中胆汁酸分析

糞便中腐敗産物分析

糞便中アンモニア分析

糞便pH測定

糞便水分測定

糞便中IgA分析 （ヒト）

受入可能な検体

必要検体量・対象成分/評価項目

送付方法

生体由来検体の返送

納品内容

価格・納期

関連ページ

※糞便理化学分析項目に必要な糞便量の目安と最適な容器

ご依頼前の同意事項

生体 DNA抽出

生体 DNA抽出

特長

概要

受入可能な検体

生体関連アーカイブ - TechnoSuruga Laboratory Co.,Ltd.

腸内環境分析用糞便採取キット・採取容器

腸内環境分析用糞便採取キット・採取容器

１，楽流カップ　WIDE

生体アンプリコンシーケンス解析

生体アンプリコンシーケンス解析

皮膚菌叢解析用採取キット　メタフロキーパー (皮膚)

皮膚菌叢解析用採取キット　メタフロキーパー (皮膚)

採取前後の採取容器の保存と期限（菌叢を維持できる目安期間）

特長

糞便中IgA分析（ヒト）

生体アンプリコンシーケンス解析 (JMBC 推奨プロトコル)

生体アンプリコンシーケンス解析 (JMBC 推奨プロトコル)

生体リアルタイムPCR解析 (定量)

生体リアルタイムPCR解析 (定量)