in silico DNA-DNA hybridization (in silico DDH) 解析

in silico DNA-DNA hybridization (in silico DDH) 解析 ホーム / 製品及びサービス 特長 概要 in silico DDH解析は、対照株と比較株の全ゲノム配列やドラフトゲノム配列をコンピュータ上で比較し、2株間の種の異同を評価する方法です。この試験はゲノムDNA抽出物を用いたDNA-DNAハイブリッド形成試験と正の相関があるとされています1,2)。近年ではin silico...

細菌DNA塩基配列解析・分子系統解析 (16S rDNA)

細菌DNA塩基配列解析・分子系統解析 (16S rDNA) ホーム / ENKI 特長 概要 細菌の同定に一般に用いられている16S rDNAでは、上流側の約500 bpの部分塩基配列で近縁種の同定がほぼ可能ですが、全長配列(Full)を解析する方がより同定の精度が高くなり、帰属種・近縁種の同定に優れます。特に、細菌を新種提唱する場合には、サンガー法による16S...

微生物同定システム「ENKI ®」- 相同性検索、系統解析ソフトウェア –

微生物同定システム「ENKI ®」- 相同性検索、系統解析ソフトウェア – ホーム / ENKI 特長 概要 DNA塩基配列解析では、国際塩基配列データベース (INSD:DDBJ/ENA/GenBank) の利用がほとんどですが、膨大なDNA塩基配列データが蓄積されているために、微生物の同定に有効なDNA塩基配列データを選択するには多大な手間と時間を要します。また、微生物分類学の専門知識がなければ、微生物の同定が難しいケースが多々あります。当社では国立遺伝学研究所 生命情報・DDBJ (DNA Data Bank...